Protein–RNA interactions for Protein: Q61412

Vsx2, Visual system homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsx2Q61412 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vsx2Q61412 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vsx2Q61412 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vsx2Q61412 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vsx2Q61412 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vsx2Q61412 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vsx2Q61412 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vsx2Q61412 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vsx2Q61412 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vsx2Q61412 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vsx2Q61412 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vsx2Q61412 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Vsx2Q61412 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vsx2Q61412 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vsx2Q61412 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vsx2Q61412 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vsx2Q61412 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vsx2Q61412 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vsx2Q61412 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vsx2Q61412 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vsx2Q61412 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Vsx2Q61412 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Vsx2Q61412 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vsx2Q61412 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vsx2Q61412 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vsx2Q61412 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vsx2Q61412 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vsx2Q61412 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vsx2Q61412 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Vsx2Q61412 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vsx2Q61412 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vsx2Q61412 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vsx2Q61412 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vsx2Q61412 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vsx2Q61412 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vsx2Q61412 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vsx2Q61412 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vsx2Q61412 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vsx2Q61412 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vsx2Q61412 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vsx2Q61412 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vsx2Q61412 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vsx2Q61412 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vsx2Q61412 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vsx2Q61412 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vsx2Q61412 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vsx2Q61412 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vsx2Q61412 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vsx2Q61412 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Vsx2Q61412 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vsx2Q61412 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vsx2Q61412 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vsx2Q61412 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vsx2Q61412 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Vsx2Q61412 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vsx2Q61412 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vsx2Q61412 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vsx2Q61412 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vsx2Q61412 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vsx2Q61412 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vsx2Q61412 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vsx2Q61412 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vsx2Q61412 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vsx2Q61412 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vsx2Q61412 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vsx2Q61412 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Vsx2Q61412 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vsx2Q61412 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vsx2Q61412 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vsx2Q61412 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vsx2Q61412 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vsx2Q61412 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vsx2Q61412 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vsx2Q61412 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Vsx2Q61412 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vsx2Q61412 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vsx2Q61412 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vsx2Q61412 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vsx2Q61412 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vsx2Q61412 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vsx2Q61412 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vsx2Q61412 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vsx2Q61412 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vsx2Q61412 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vsx2Q61412 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vsx2Q61412 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vsx2Q61412 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vsx2Q61412 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Vsx2Q61412 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vsx2Q61412 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vsx2Q61412 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vsx2Q61412 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vsx2Q61412 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vsx2Q61412 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vsx2Q61412 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vsx2Q61412 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vsx2Q61412 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vsx2Q61412 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vsx2Q61412 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vsx2Q61412 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms