Protein–RNA interactions for Protein: Q61313

Tfap2b, Transcription factor AP-2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2bQ61313 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tfap2bQ61313 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tfap2bQ61313 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tfap2bQ61313 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tfap2bQ61313 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tfap2bQ61313 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tfap2bQ61313 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tfap2bQ61313 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tfap2bQ61313 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tfap2bQ61313 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tfap2bQ61313 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tfap2bQ61313 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tfap2bQ61313 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tfap2bQ61313 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tfap2bQ61313 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tfap2bQ61313 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tfap2bQ61313 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tfap2bQ61313 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tfap2bQ61313 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tfap2bQ61313 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tfap2bQ61313 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tfap2bQ61313 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tfap2bQ61313 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tfap2bQ61313 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tfap2bQ61313 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tfap2bQ61313 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tfap2bQ61313 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tfap2bQ61313 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tfap2bQ61313 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tfap2bQ61313 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tfap2bQ61313 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tfap2bQ61313 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tfap2bQ61313 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tfap2bQ61313 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tfap2bQ61313 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tfap2bQ61313 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tfap2bQ61313 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tfap2bQ61313 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tfap2bQ61313 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tfap2bQ61313 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tfap2bQ61313 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tfap2bQ61313 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tfap2bQ61313 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tfap2bQ61313 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Tfap2bQ61313 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Tfap2bQ61313 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tfap2bQ61313 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Tfap2bQ61313 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tfap2bQ61313 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tfap2bQ61313 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tfap2bQ61313 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tfap2bQ61313 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tfap2bQ61313 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tfap2bQ61313 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tfap2bQ61313 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Tfap2bQ61313 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Tfap2bQ61313 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Tfap2bQ61313 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Tfap2bQ61313 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Tfap2bQ61313 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tfap2bQ61313 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tfap2bQ61313 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tfap2bQ61313 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tfap2bQ61313 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tfap2bQ61313 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Tfap2bQ61313 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tfap2bQ61313 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tfap2bQ61313 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Tfap2bQ61313 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tfap2bQ61313 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tfap2bQ61313 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tfap2bQ61313 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tfap2bQ61313 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tfap2bQ61313 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Tfap2bQ61313 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tfap2bQ61313 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tfap2bQ61313 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Tfap2bQ61313 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tfap2bQ61313 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tfap2bQ61313 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tfap2bQ61313 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tfap2bQ61313 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tfap2bQ61313 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tfap2bQ61313 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tfap2bQ61313 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Tfap2bQ61313 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tfap2bQ61313 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tfap2bQ61313 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tfap2bQ61313 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tfap2bQ61313 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tfap2bQ61313 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tfap2bQ61313 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tfap2bQ61313 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tfap2bQ61313 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tfap2bQ61313 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tfap2bQ61313 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tfap2bQ61313 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tfap2bQ61313 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tfap2bQ61313 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Tfap2bQ61313 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms