Protein–RNA interactions for Protein: Q61286

Tcf12, Transcription factor 12, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcf12Q61286 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tcf12Q61286 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tcf12Q61286 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tcf12Q61286 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tcf12Q61286 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tcf12Q61286 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tcf12Q61286 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tcf12Q61286 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tcf12Q61286 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tcf12Q61286 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tcf12Q61286 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tcf12Q61286 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Tcf12Q61286 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tcf12Q61286 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tcf12Q61286 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tcf12Q61286 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tcf12Q61286 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tcf12Q61286 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tcf12Q61286 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tcf12Q61286 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tcf12Q61286 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tcf12Q61286 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tcf12Q61286 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tcf12Q61286 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tcf12Q61286 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tcf12Q61286 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tcf12Q61286 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Tcf12Q61286 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tcf12Q61286 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tcf12Q61286 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tcf12Q61286 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tcf12Q61286 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tcf12Q61286 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tcf12Q61286 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tcf12Q61286 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tcf12Q61286 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tcf12Q61286 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tcf12Q61286 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Tcf12Q61286 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tcf12Q61286 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tcf12Q61286 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tcf12Q61286 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tcf12Q61286 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tcf12Q61286 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tcf12Q61286 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tcf12Q61286 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tcf12Q61286 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tcf12Q61286 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tcf12Q61286 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tcf12Q61286 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tcf12Q61286 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Tcf12Q61286 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tcf12Q61286 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tcf12Q61286 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tcf12Q61286 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tcf12Q61286 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tcf12Q61286 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tcf12Q61286 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tcf12Q61286 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tcf12Q61286 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tcf12Q61286 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tcf12Q61286 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tcf12Q61286 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tcf12Q61286 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tcf12Q61286 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tcf12Q61286 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tcf12Q61286 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tcf12Q61286 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tcf12Q61286 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tcf12Q61286 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tcf12Q61286 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tcf12Q61286 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tcf12Q61286 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tcf12Q61286 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tcf12Q61286 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tcf12Q61286 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tcf12Q61286 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tcf12Q61286 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tcf12Q61286 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tcf12Q61286 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tcf12Q61286 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tcf12Q61286 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tcf12Q61286 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tcf12Q61286 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tcf12Q61286 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tcf12Q61286 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tcf12Q61286 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tcf12Q61286 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tcf12Q61286 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tcf12Q61286 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tcf12Q61286 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tcf12Q61286 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tcf12Q61286 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tcf12Q61286 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tcf12Q61286 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tcf12Q61286 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tcf12Q61286 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tcf12Q61286 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Tcf12Q61286 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Tcf12Q61286 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms