Protein–RNA interactions for Protein: Q61191

Hcfc1, Host cell factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,045 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcfc1Q61191 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hcfc1Q61191 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hcfc1Q61191 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hcfc1Q61191 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hcfc1Q61191 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Hcfc1Q61191 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hcfc1Q61191 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hcfc1Q61191 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hcfc1Q61191 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hcfc1Q61191 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hcfc1Q61191 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hcfc1Q61191 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hcfc1Q61191 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hcfc1Q61191 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hcfc1Q61191 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hcfc1Q61191 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Hcfc1Q61191 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Hcfc1Q61191 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hcfc1Q61191 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hcfc1Q61191 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hcfc1Q61191 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hcfc1Q61191 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hcfc1Q61191 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hcfc1Q61191 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hcfc1Q61191 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hcfc1Q61191 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Hcfc1Q61191 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hcfc1Q61191 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Hcfc1Q61191 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hcfc1Q61191 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hcfc1Q61191 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hcfc1Q61191 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hcfc1Q61191 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hcfc1Q61191 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hcfc1Q61191 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Hcfc1Q61191 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hcfc1Q61191 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hcfc1Q61191 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hcfc1Q61191 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hcfc1Q61191 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
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Hcfc1Q61191 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hcfc1Q61191 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hcfc1Q61191 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hcfc1Q61191 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hcfc1Q61191 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hcfc1Q61191 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Hcfc1Q61191 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hcfc1Q61191 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hcfc1Q61191 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hcfc1Q61191 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hcfc1Q61191 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hcfc1Q61191 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hcfc1Q61191 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Hcfc1Q61191 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Hcfc1Q61191 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Hcfc1Q61191 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Hcfc1Q61191 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hcfc1Q61191 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hcfc1Q61191 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hcfc1Q61191 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hcfc1Q61191 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hcfc1Q61191 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hcfc1Q61191 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hcfc1Q61191 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hcfc1Q61191 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hcfc1Q61191 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hcfc1Q61191 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hcfc1Q61191 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hcfc1Q61191 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hcfc1Q61191 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hcfc1Q61191 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hcfc1Q61191 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hcfc1Q61191 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hcfc1Q61191 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hcfc1Q61191 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Hcfc1Q61191 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hcfc1Q61191 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hcfc1Q61191 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hcfc1Q61191 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hcfc1Q61191 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Hcfc1Q61191 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Hcfc1Q61191 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hcfc1Q61191 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hcfc1Q61191 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms