Protein–RNA interactions for Protein: Q61009

Scarb1, Scavenger receptor class B member 1, mousemouse

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarb1Q61009 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Scarb1Q61009 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scarb1Q61009 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scarb1Q61009 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Scarb1Q61009 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scarb1Q61009 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scarb1Q61009 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scarb1Q61009 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scarb1Q61009 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scarb1Q61009 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scarb1Q61009 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scarb1Q61009 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scarb1Q61009 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Scarb1Q61009 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scarb1Q61009 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scarb1Q61009 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scarb1Q61009 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scarb1Q61009 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Scarb1Q61009 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scarb1Q61009 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scarb1Q61009 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scarb1Q61009 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scarb1Q61009 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scarb1Q61009 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Scarb1Q61009 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scarb1Q61009 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scarb1Q61009 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scarb1Q61009 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scarb1Q61009 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scarb1Q61009 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scarb1Q61009 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scarb1Q61009 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scarb1Q61009 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scarb1Q61009 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scarb1Q61009 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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Scarb1Q61009 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Scarb1Q61009 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Scarb1Q61009 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Scarb1Q61009 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Scarb1Q61009 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scarb1Q61009 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Scarb1Q61009 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Scarb1Q61009 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scarb1Q61009 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scarb1Q61009 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Scarb1Q61009 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scarb1Q61009 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scarb1Q61009 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scarb1Q61009 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scarb1Q61009 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scarb1Q61009 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Scarb1Q61009 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Scarb1Q61009 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scarb1Q61009 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scarb1Q61009 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scarb1Q61009 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scarb1Q61009 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scarb1Q61009 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scarb1Q61009 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scarb1Q61009 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scarb1Q61009 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scarb1Q61009 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scarb1Q61009 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scarb1Q61009 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scarb1Q61009 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scarb1Q61009 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scarb1Q61009 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scarb1Q61009 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scarb1Q61009 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scarb1Q61009 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scarb1Q61009 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scarb1Q61009 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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