Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klf3Q60980 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klf3Q60980 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klf3Q60980 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klf3Q60980 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klf3Q60980 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klf3Q60980 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klf3Q60980 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klf3Q60980 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klf3Q60980 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klf3Q60980 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klf3Q60980 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Klf3Q60980 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Klf3Q60980 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klf3Q60980 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Klf3Q60980 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klf3Q60980 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klf3Q60980 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klf3Q60980 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klf3Q60980 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klf3Q60980 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klf3Q60980 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klf3Q60980 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klf3Q60980 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klf3Q60980 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klf3Q60980 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klf3Q60980 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klf3Q60980 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klf3Q60980 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klf3Q60980 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klf3Q60980 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klf3Q60980 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klf3Q60980 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klf3Q60980 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klf3Q60980 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klf3Q60980 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klf3Q60980 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klf3Q60980 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Klf3Q60980 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klf3Q60980 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klf3Q60980 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klf3Q60980 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klf3Q60980 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klf3Q60980 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klf3Q60980 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klf3Q60980 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klf3Q60980 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klf3Q60980 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klf3Q60980 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klf3Q60980 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klf3Q60980 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klf3Q60980 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klf3Q60980 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klf3Q60980 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klf3Q60980 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klf3Q60980 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klf3Q60980 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Klf3Q60980 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klf3Q60980 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Klf3Q60980 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klf3Q60980 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klf3Q60980 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klf3Q60980 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klf3Q60980 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klf3Q60980 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klf3Q60980 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klf3Q60980 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klf3Q60980 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klf3Q60980 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klf3Q60980 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klf3Q60980 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klf3Q60980 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klf3Q60980 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Klf3Q60980 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Klf3Q60980 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Klf3Q60980 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Klf3Q60980 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Klf3Q60980 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klf3Q60980 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klf3Q60980 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Klf3Q60980 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Klf3Q60980 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Klf3Q60980 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klf3Q60980 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klf3Q60980 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klf3Q60980 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klf3Q60980 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klf3Q60980 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klf3Q60980 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klf3Q60980 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klf3Q60980 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klf3Q60980 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klf3Q60980 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klf3Q60980 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klf3Q60980 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klf3Q60980 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klf3Q60980 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klf3Q60980 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klf3Q60980 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klf3Q60980 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms