Protein–RNA interactions for Protein: Q60846

Tnfrsf8, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 8, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf8Q60846 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnfrsf8Q60846 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnfrsf8Q60846 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnfrsf8Q60846 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnfrsf8Q60846 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnfrsf8Q60846 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnfrsf8Q60846 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnfrsf8Q60846 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnfrsf8Q60846 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnfrsf8Q60846 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnfrsf8Q60846 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tnfrsf8Q60846 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tnfrsf8Q60846 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tnfrsf8Q60846 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tnfrsf8Q60846 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tnfrsf8Q60846 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tnfrsf8Q60846 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Tnfrsf8Q60846 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tnfrsf8Q60846 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tnfrsf8Q60846 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tnfrsf8Q60846 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tnfrsf8Q60846 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tnfrsf8Q60846 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tnfrsf8Q60846 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tnfrsf8Q60846 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tnfrsf8Q60846 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnfrsf8Q60846 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnfrsf8Q60846 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnfrsf8Q60846 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnfrsf8Q60846 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnfrsf8Q60846 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnfrsf8Q60846 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnfrsf8Q60846 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnfrsf8Q60846 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnfrsf8Q60846 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnfrsf8Q60846 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnfrsf8Q60846 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnfrsf8Q60846 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnfrsf8Q60846 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnfrsf8Q60846 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnfrsf8Q60846 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnfrsf8Q60846 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnfrsf8Q60846 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnfrsf8Q60846 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnfrsf8Q60846 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnfrsf8Q60846 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnfrsf8Q60846 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnfrsf8Q60846 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnfrsf8Q60846 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnfrsf8Q60846 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnfrsf8Q60846 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnfrsf8Q60846 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnfrsf8Q60846 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnfrsf8Q60846 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnfrsf8Q60846 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnfrsf8Q60846 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnfrsf8Q60846 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnfrsf8Q60846 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnfrsf8Q60846 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnfrsf8Q60846 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnfrsf8Q60846 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnfrsf8Q60846 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnfrsf8Q60846 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnfrsf8Q60846 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnfrsf8Q60846 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnfrsf8Q60846 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnfrsf8Q60846 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnfrsf8Q60846 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnfrsf8Q60846 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnfrsf8Q60846 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnfrsf8Q60846 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnfrsf8Q60846 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnfrsf8Q60846 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnfrsf8Q60846 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnfrsf8Q60846 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnfrsf8Q60846 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Tnfrsf8Q60846 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tnfrsf8Q60846 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tnfrsf8Q60846 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tnfrsf8Q60846 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tnfrsf8Q60846 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tnfrsf8Q60846 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Tnfrsf8Q60846 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tnfrsf8Q60846 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tnfrsf8Q60846 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tnfrsf8Q60846 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tnfrsf8Q60846 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tnfrsf8Q60846 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tnfrsf8Q60846 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tnfrsf8Q60846 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Tnfrsf8Q60846 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tnfrsf8Q60846 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnfrsf8Q60846 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnfrsf8Q60846 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnfrsf8Q60846 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnfrsf8Q60846 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnfrsf8Q60846 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnfrsf8Q60846 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnfrsf8Q60846 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnfrsf8Q60846 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms