Protein–RNA interactions for Protein: Q60793

Klf4, Krueppel-like factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf4Q60793 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Klf4Q60793 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Klf4Q60793 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Klf4Q60793 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Klf4Q60793 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Klf4Q60793 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Klf4Q60793 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Klf4Q60793 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Klf4Q60793 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Klf4Q60793 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Klf4Q60793 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Klf4Q60793 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Klf4Q60793 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Klf4Q60793 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Klf4Q60793 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Klf4Q60793 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Klf4Q60793 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Klf4Q60793 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Klf4Q60793 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Klf4Q60793 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Klf4Q60793 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Klf4Q60793 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Klf4Q60793 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Klf4Q60793 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Klf4Q60793 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Klf4Q60793 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Klf4Q60793 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Klf4Q60793 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Klf4Q60793 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Klf4Q60793 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Klf4Q60793 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Klf4Q60793 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Klf4Q60793 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Klf4Q60793 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Klf4Q60793 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Klf4Q60793 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Klf4Q60793 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Klf4Q60793 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Klf4Q60793 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Klf4Q60793 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Klf4Q60793 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Klf4Q60793 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Klf4Q60793 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Klf4Q60793 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Klf4Q60793 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Klf4Q60793 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Klf4Q60793 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Klf4Q60793 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Klf4Q60793 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Klf4Q60793 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Klf4Q60793 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Klf4Q60793 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Klf4Q60793 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Klf4Q60793 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Klf4Q60793 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Klf4Q60793 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Klf4Q60793 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Klf4Q60793 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Klf4Q60793 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Klf4Q60793 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Klf4Q60793 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Klf4Q60793 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Klf4Q60793 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Klf4Q60793 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Klf4Q60793 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Klf4Q60793 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Klf4Q60793 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Klf4Q60793 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Klf4Q60793 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Klf4Q60793 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Klf4Q60793 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Klf4Q60793 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Klf4Q60793 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Klf4Q60793 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Klf4Q60793 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Klf4Q60793 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Klf4Q60793 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Klf4Q60793 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Klf4Q60793 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Klf4Q60793 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Klf4Q60793 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Klf4Q60793 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Klf4Q60793 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Klf4Q60793 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Klf4Q60793 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Klf4Q60793 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Klf4Q60793 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Klf4Q60793 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Klf4Q60793 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Klf4Q60793 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Klf4Q60793 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Klf4Q60793 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Klf4Q60793 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Klf4Q60793 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Klf4Q60793 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Klf4Q60793 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Klf4Q60793 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Klf4Q60793 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Klf4Q60793 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Klf4Q60793 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms