Protein–RNA interactions for Protein: Q60778

Nfkbib, NF-kappa-B inhibitor beta, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfkbibQ60778 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NfkbibQ60778 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NfkbibQ60778 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NfkbibQ60778 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NfkbibQ60778 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NfkbibQ60778 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NfkbibQ60778 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NfkbibQ60778 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NfkbibQ60778 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NfkbibQ60778 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NfkbibQ60778 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NfkbibQ60778 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NfkbibQ60778 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NfkbibQ60778 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NfkbibQ60778 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NfkbibQ60778 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NfkbibQ60778 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NfkbibQ60778 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NfkbibQ60778 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NfkbibQ60778 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NfkbibQ60778 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NfkbibQ60778 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NfkbibQ60778 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NfkbibQ60778 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NfkbibQ60778 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NfkbibQ60778 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NfkbibQ60778 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NfkbibQ60778 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NfkbibQ60778 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NfkbibQ60778 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NfkbibQ60778 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NfkbibQ60778 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NfkbibQ60778 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NfkbibQ60778 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NfkbibQ60778 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NfkbibQ60778 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NfkbibQ60778 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NfkbibQ60778 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
NfkbibQ60778 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NfkbibQ60778 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NfkbibQ60778 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NfkbibQ60778 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NfkbibQ60778 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NfkbibQ60778 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NfkbibQ60778 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NfkbibQ60778 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NfkbibQ60778 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NfkbibQ60778 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NfkbibQ60778 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NfkbibQ60778 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NfkbibQ60778 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NfkbibQ60778 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NfkbibQ60778 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NfkbibQ60778 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NfkbibQ60778 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NfkbibQ60778 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NfkbibQ60778 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NfkbibQ60778 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NfkbibQ60778 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NfkbibQ60778 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NfkbibQ60778 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NfkbibQ60778 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NfkbibQ60778 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NfkbibQ60778 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NfkbibQ60778 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NfkbibQ60778 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NfkbibQ60778 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NfkbibQ60778 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NfkbibQ60778 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NfkbibQ60778 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NfkbibQ60778 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NfkbibQ60778 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NfkbibQ60778 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NfkbibQ60778 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NfkbibQ60778 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NfkbibQ60778 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NfkbibQ60778 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NfkbibQ60778 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NfkbibQ60778 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NfkbibQ60778 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NfkbibQ60778 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NfkbibQ60778 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NfkbibQ60778 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NfkbibQ60778 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NfkbibQ60778 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NfkbibQ60778 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NfkbibQ60778 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NfkbibQ60778 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NfkbibQ60778 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NfkbibQ60778 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NfkbibQ60778 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NfkbibQ60778 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NfkbibQ60778 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NfkbibQ60778 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NfkbibQ60778 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NfkbibQ60778 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NfkbibQ60778 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NfkbibQ60778 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NfkbibQ60778 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NfkbibQ60778 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms