Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Atf3Q60765 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Atf3Q60765 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Atf3Q60765 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Atf3Q60765 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Atf3Q60765 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Atf3Q60765 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Atf3Q60765 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Atf3Q60765 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Atf3Q60765 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Atf3Q60765 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Atf3Q60765 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Atf3Q60765 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Atf3Q60765 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Atf3Q60765 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Atf3Q60765 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Atf3Q60765 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Atf3Q60765 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Atf3Q60765 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Atf3Q60765 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Atf3Q60765 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Atf3Q60765 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Atf3Q60765 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Atf3Q60765 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Atf3Q60765 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Atf3Q60765 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Atf3Q60765 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Atf3Q60765 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Atf3Q60765 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Atf3Q60765 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Atf3Q60765 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Atf3Q60765 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Atf3Q60765 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Atf3Q60765 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Atf3Q60765 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Atf3Q60765 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Atf3Q60765 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Atf3Q60765 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Atf3Q60765 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Atf3Q60765 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Atf3Q60765 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Atf3Q60765 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Atf3Q60765 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Atf3Q60765 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Atf3Q60765 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Atf3Q60765 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Atf3Q60765 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Atf3Q60765 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Atf3Q60765 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Atf3Q60765 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Atf3Q60765 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Atf3Q60765 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Atf3Q60765 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Atf3Q60765 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Atf3Q60765 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Atf3Q60765 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Atf3Q60765 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Atf3Q60765 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Atf3Q60765 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Atf3Q60765 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Atf3Q60765 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Atf3Q60765 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Atf3Q60765 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Atf3Q60765 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Atf3Q60765 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Atf3Q60765 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Atf3Q60765 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Atf3Q60765 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Atf3Q60765 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Atf3Q60765 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Atf3Q60765 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Atf3Q60765 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Atf3Q60765 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Atf3Q60765 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Atf3Q60765 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Atf3Q60765 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Atf3Q60765 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Atf3Q60765 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Atf3Q60765 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Atf3Q60765 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Atf3Q60765 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Atf3Q60765 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Atf3Q60765 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Atf3Q60765 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Atf3Q60765 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Atf3Q60765 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Atf3Q60765 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Atf3Q60765 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Atf3Q60765 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Atf3Q60765 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Atf3Q60765 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Atf3Q60765 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Atf3Q60765 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Atf3Q60765 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Atf3Q60765 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Atf3Q60765 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Atf3Q60765 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Atf3Q60765 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Atf3Q60765 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Atf3Q60765 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms