Protein–RNA interactions for Protein: Q60737

Csnk2a1, Casein kinase II subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a1Q60737 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Csnk2a1Q60737 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Csnk2a1Q60737 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Csnk2a1Q60737 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Csnk2a1Q60737 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Csnk2a1Q60737 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Csnk2a1Q60737 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Csnk2a1Q60737 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Csnk2a1Q60737 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Csnk2a1Q60737 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Csnk2a1Q60737 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Csnk2a1Q60737 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Csnk2a1Q60737 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Csnk2a1Q60737 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Csnk2a1Q60737 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Csnk2a1Q60737 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Csnk2a1Q60737 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Csnk2a1Q60737 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Csnk2a1Q60737 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Csnk2a1Q60737 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Csnk2a1Q60737 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Csnk2a1Q60737 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Csnk2a1Q60737 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Csnk2a1Q60737 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Csnk2a1Q60737 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Csnk2a1Q60737 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Csnk2a1Q60737 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Csnk2a1Q60737 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Csnk2a1Q60737 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Csnk2a1Q60737 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Csnk2a1Q60737 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Csnk2a1Q60737 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Csnk2a1Q60737 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Csnk2a1Q60737 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Csnk2a1Q60737 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Csnk2a1Q60737 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Csnk2a1Q60737 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Csnk2a1Q60737 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Csnk2a1Q60737 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Csnk2a1Q60737 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Csnk2a1Q60737 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Csnk2a1Q60737 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Csnk2a1Q60737 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Csnk2a1Q60737 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Csnk2a1Q60737 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Csnk2a1Q60737 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Csnk2a1Q60737 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Csnk2a1Q60737 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Csnk2a1Q60737 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Csnk2a1Q60737 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Csnk2a1Q60737 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Csnk2a1Q60737 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Csnk2a1Q60737 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Csnk2a1Q60737 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Csnk2a1Q60737 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Csnk2a1Q60737 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Csnk2a1Q60737 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Csnk2a1Q60737 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Csnk2a1Q60737 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Csnk2a1Q60737 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Csnk2a1Q60737 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Csnk2a1Q60737 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Csnk2a1Q60737 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Csnk2a1Q60737 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Csnk2a1Q60737 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Csnk2a1Q60737 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Csnk2a1Q60737 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Csnk2a1Q60737 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Csnk2a1Q60737 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Csnk2a1Q60737 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Csnk2a1Q60737 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Csnk2a1Q60737 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Csnk2a1Q60737 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Csnk2a1Q60737 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Csnk2a1Q60737 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Csnk2a1Q60737 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Csnk2a1Q60737 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Csnk2a1Q60737 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Csnk2a1Q60737 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Csnk2a1Q60737 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Csnk2a1Q60737 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Csnk2a1Q60737 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csnk2a1Q60737 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csnk2a1Q60737 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csnk2a1Q60737 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csnk2a1Q60737 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csnk2a1Q60737 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Csnk2a1Q60737 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csnk2a1Q60737 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Csnk2a1Q60737 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csnk2a1Q60737 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csnk2a1Q60737 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csnk2a1Q60737 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csnk2a1Q60737 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csnk2a1Q60737 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csnk2a1Q60737 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csnk2a1Q60737 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csnk2a1Q60737 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csnk2a1Q60737 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csnk2a1Q60737 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms