Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4D8

Slc5a6, Sodium-dependent multivitamin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a6Q5U4D8 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Slc5a6Q5U4D8 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Slc5a6Q5U4D8 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Slc5a6Q5U4D8 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Slc5a6Q5U4D8 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Slc5a6Q5U4D8 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Slc5a6Q5U4D8 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Slc5a6Q5U4D8 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Slc5a6Q5U4D8 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Slc5a6Q5U4D8 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Slc5a6Q5U4D8 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Slc5a6Q5U4D8 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Slc5a6Q5U4D8 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Slc5a6Q5U4D8 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Slc5a6Q5U4D8 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Slc5a6Q5U4D8 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Slc5a6Q5U4D8 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Slc5a6Q5U4D8 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Slc5a6Q5U4D8 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Slc5a6Q5U4D8 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Slc5a6Q5U4D8 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Slc5a6Q5U4D8 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Slc5a6Q5U4D8 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Slc5a6Q5U4D8 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Slc5a6Q5U4D8 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Slc5a6Q5U4D8 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Slc5a6Q5U4D8 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Slc5a6Q5U4D8 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Slc5a6Q5U4D8 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Slc5a6Q5U4D8 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Slc5a6Q5U4D8 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc5a6Q5U4D8 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc5a6Q5U4D8 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc5a6Q5U4D8 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc5a6Q5U4D8 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc5a6Q5U4D8 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc5a6Q5U4D8 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc5a6Q5U4D8 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc5a6Q5U4D8 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc5a6Q5U4D8 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc5a6Q5U4D8 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc5a6Q5U4D8 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc5a6Q5U4D8 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc5a6Q5U4D8 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc5a6Q5U4D8 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc5a6Q5U4D8 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc5a6Q5U4D8 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc5a6Q5U4D8 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc5a6Q5U4D8 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc5a6Q5U4D8 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc5a6Q5U4D8 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc5a6Q5U4D8 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc5a6Q5U4D8 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc5a6Q5U4D8 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc5a6Q5U4D8 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc5a6Q5U4D8 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc5a6Q5U4D8 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Slc5a6Q5U4D8 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Slc5a6Q5U4D8 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc5a6Q5U4D8 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc5a6Q5U4D8 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Slc5a6Q5U4D8 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc5a6Q5U4D8 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc5a6Q5U4D8 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Slc5a6Q5U4D8 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc5a6Q5U4D8 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc5a6Q5U4D8 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Slc5a6Q5U4D8 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc5a6Q5U4D8 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc5a6Q5U4D8 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc5a6Q5U4D8 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc5a6Q5U4D8 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc5a6Q5U4D8 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc5a6Q5U4D8 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Slc5a6Q5U4D8 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc5a6Q5U4D8 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc5a6Q5U4D8 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc5a6Q5U4D8 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Slc5a6Q5U4D8 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc5a6Q5U4D8 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc5a6Q5U4D8 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc5a6Q5U4D8 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc5a6Q5U4D8 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc5a6Q5U4D8 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc5a6Q5U4D8 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc5a6Q5U4D8 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc5a6Q5U4D8 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc5a6Q5U4D8 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc5a6Q5U4D8 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc5a6Q5U4D8 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc5a6Q5U4D8 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc5a6Q5U4D8 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc5a6Q5U4D8 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc5a6Q5U4D8 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc5a6Q5U4D8 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc5a6Q5U4D8 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc5a6Q5U4D8 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc5a6Q5U4D8 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc5a6Q5U4D8 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc5a6Q5U4D8 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms