Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVR0

Tbc1d9b, TBC1 domain family member 9B, mousemouse

Predictions only

Length 1,263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbc1d9bQ5SVR0 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tbc1d9bQ5SVR0 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tbc1d9bQ5SVR0 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tbc1d9bQ5SVR0 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tbc1d9bQ5SVR0 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tbc1d9bQ5SVR0 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tbc1d9bQ5SVR0 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Tbc1d9bQ5SVR0 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tbc1d9bQ5SVR0 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Tbc1d9bQ5SVR0 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tbc1d9bQ5SVR0 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tbc1d9bQ5SVR0 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tbc1d9bQ5SVR0 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tbc1d9bQ5SVR0 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tbc1d9bQ5SVR0 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tbc1d9bQ5SVR0 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tbc1d9bQ5SVR0 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tbc1d9bQ5SVR0 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tbc1d9bQ5SVR0 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tbc1d9bQ5SVR0 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tbc1d9bQ5SVR0 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tbc1d9bQ5SVR0 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tbc1d9bQ5SVR0 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tbc1d9bQ5SVR0 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tbc1d9bQ5SVR0 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tbc1d9bQ5SVR0 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tbc1d9bQ5SVR0 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Tbc1d9bQ5SVR0 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tbc1d9bQ5SVR0 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Tbc1d9bQ5SVR0 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tbc1d9bQ5SVR0 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tbc1d9bQ5SVR0 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tbc1d9bQ5SVR0 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tbc1d9bQ5SVR0 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tbc1d9bQ5SVR0 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tbc1d9bQ5SVR0 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tbc1d9bQ5SVR0 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tbc1d9bQ5SVR0 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tbc1d9bQ5SVR0 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tbc1d9bQ5SVR0 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tbc1d9bQ5SVR0 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Tbc1d9bQ5SVR0 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tbc1d9bQ5SVR0 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tbc1d9bQ5SVR0 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tbc1d9bQ5SVR0 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tbc1d9bQ5SVR0 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tbc1d9bQ5SVR0 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tbc1d9bQ5SVR0 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tbc1d9bQ5SVR0 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tbc1d9bQ5SVR0 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Tbc1d9bQ5SVR0 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Tbc1d9bQ5SVR0 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Tbc1d9bQ5SVR0 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tbc1d9bQ5SVR0 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tbc1d9bQ5SVR0 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tbc1d9bQ5SVR0 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tbc1d9bQ5SVR0 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tbc1d9bQ5SVR0 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tbc1d9bQ5SVR0 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tbc1d9bQ5SVR0 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tbc1d9bQ5SVR0 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tbc1d9bQ5SVR0 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tbc1d9bQ5SVR0 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tbc1d9bQ5SVR0 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tbc1d9bQ5SVR0 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tbc1d9bQ5SVR0 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tbc1d9bQ5SVR0 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tbc1d9bQ5SVR0 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tbc1d9bQ5SVR0 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tbc1d9bQ5SVR0 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tbc1d9bQ5SVR0 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tbc1d9bQ5SVR0 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tbc1d9bQ5SVR0 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tbc1d9bQ5SVR0 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Tbc1d9bQ5SVR0 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tbc1d9bQ5SVR0 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tbc1d9bQ5SVR0 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tbc1d9bQ5SVR0 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tbc1d9bQ5SVR0 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tbc1d9bQ5SVR0 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tbc1d9bQ5SVR0 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tbc1d9bQ5SVR0 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tbc1d9bQ5SVR0 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tbc1d9bQ5SVR0 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tbc1d9bQ5SVR0 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tbc1d9bQ5SVR0 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tbc1d9bQ5SVR0 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tbc1d9bQ5SVR0 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tbc1d9bQ5SVR0 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tbc1d9bQ5SVR0 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tbc1d9bQ5SVR0 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tbc1d9bQ5SVR0 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tbc1d9bQ5SVR0 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tbc1d9bQ5SVR0 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tbc1d9bQ5SVR0 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tbc1d9bQ5SVR0 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tbc1d9bQ5SVR0 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tbc1d9bQ5SVR0 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Tbc1d9bQ5SVR0 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tbc1d9bQ5SVR0 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms