Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUE8

Ankrd40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd40Q5SUE8 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ankrd40Q5SUE8 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Ankrd40Q5SUE8 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ankrd40Q5SUE8 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ankrd40Q5SUE8 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ankrd40Q5SUE8 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ankrd40Q5SUE8 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ankrd40Q5SUE8 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ankrd40Q5SUE8 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ankrd40Q5SUE8 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ankrd40Q5SUE8 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ankrd40Q5SUE8 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ankrd40Q5SUE8 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ankrd40Q5SUE8 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ankrd40Q5SUE8 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ankrd40Q5SUE8 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ankrd40Q5SUE8 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ankrd40Q5SUE8 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ankrd40Q5SUE8 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Ankrd40Q5SUE8 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ankrd40Q5SUE8 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ankrd40Q5SUE8 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ankrd40Q5SUE8 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ankrd40Q5SUE8 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ankrd40Q5SUE8 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ankrd40Q5SUE8 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ankrd40Q5SUE8 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ankrd40Q5SUE8 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ankrd40Q5SUE8 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ankrd40Q5SUE8 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ankrd40Q5SUE8 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ankrd40Q5SUE8 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ankrd40Q5SUE8 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ankrd40Q5SUE8 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ankrd40Q5SUE8 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ankrd40Q5SUE8 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ankrd40Q5SUE8 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ankrd40Q5SUE8 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Ankrd40Q5SUE8 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ankrd40Q5SUE8 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ankrd40Q5SUE8 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ankrd40Q5SUE8 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ankrd40Q5SUE8 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ankrd40Q5SUE8 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ankrd40Q5SUE8 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ankrd40Q5SUE8 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ankrd40Q5SUE8 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ankrd40Q5SUE8 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Ankrd40Q5SUE8 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ankrd40Q5SUE8 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ankrd40Q5SUE8 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ankrd40Q5SUE8 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ankrd40Q5SUE8 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ankrd40Q5SUE8 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ankrd40Q5SUE8 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ankrd40Q5SUE8 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ankrd40Q5SUE8 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ankrd40Q5SUE8 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ankrd40Q5SUE8 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ankrd40Q5SUE8 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ankrd40Q5SUE8 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ankrd40Q5SUE8 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ankrd40Q5SUE8 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ankrd40Q5SUE8 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ankrd40Q5SUE8 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ankrd40Q5SUE8 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ankrd40Q5SUE8 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ankrd40Q5SUE8 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ankrd40Q5SUE8 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ankrd40Q5SUE8 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ankrd40Q5SUE8 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ankrd40Q5SUE8 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ankrd40Q5SUE8 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ankrd40Q5SUE8 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ankrd40Q5SUE8 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Ankrd40Q5SUE8 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ankrd40Q5SUE8 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ankrd40Q5SUE8 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ankrd40Q5SUE8 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ankrd40Q5SUE8 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ankrd40Q5SUE8 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ankrd40Q5SUE8 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ankrd40Q5SUE8 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ankrd40Q5SUE8 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ankrd40Q5SUE8 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ankrd40Q5SUE8 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ankrd40Q5SUE8 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ankrd40Q5SUE8 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ankrd40Q5SUE8 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ankrd40Q5SUE8 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ankrd40Q5SUE8 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ankrd40Q5SUE8 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ankrd40Q5SUE8 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ankrd40Q5SUE8 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ankrd40Q5SUE8 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ankrd40Q5SUE8 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ankrd40Q5SUE8 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ankrd40Q5SUE8 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ankrd40Q5SUE8 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ankrd40Q5SUE8 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms