Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSK3

Tefm, Transcription elongation factor, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TefmQ5SSK3 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TefmQ5SSK3 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TefmQ5SSK3 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TefmQ5SSK3 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TefmQ5SSK3 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TefmQ5SSK3 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TefmQ5SSK3 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TefmQ5SSK3 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TefmQ5SSK3 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TefmQ5SSK3 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
TefmQ5SSK3 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TefmQ5SSK3 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TefmQ5SSK3 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TefmQ5SSK3 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
TefmQ5SSK3 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TefmQ5SSK3 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
TefmQ5SSK3 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
TefmQ5SSK3 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TefmQ5SSK3 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TefmQ5SSK3 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TefmQ5SSK3 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TefmQ5SSK3 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TefmQ5SSK3 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TefmQ5SSK3 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TefmQ5SSK3 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TefmQ5SSK3 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TefmQ5SSK3 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TefmQ5SSK3 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TefmQ5SSK3 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TefmQ5SSK3 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TefmQ5SSK3 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TefmQ5SSK3 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TefmQ5SSK3 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TefmQ5SSK3 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TefmQ5SSK3 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TefmQ5SSK3 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TefmQ5SSK3 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TefmQ5SSK3 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TefmQ5SSK3 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TefmQ5SSK3 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TefmQ5SSK3 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TefmQ5SSK3 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TefmQ5SSK3 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TefmQ5SSK3 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TefmQ5SSK3 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TefmQ5SSK3 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TefmQ5SSK3 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TefmQ5SSK3 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TefmQ5SSK3 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TefmQ5SSK3 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TefmQ5SSK3 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TefmQ5SSK3 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TefmQ5SSK3 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TefmQ5SSK3 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TefmQ5SSK3 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TefmQ5SSK3 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TefmQ5SSK3 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TefmQ5SSK3 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TefmQ5SSK3 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TefmQ5SSK3 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TefmQ5SSK3 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TefmQ5SSK3 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TefmQ5SSK3 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TefmQ5SSK3 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TefmQ5SSK3 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TefmQ5SSK3 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TefmQ5SSK3 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TefmQ5SSK3 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TefmQ5SSK3 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TefmQ5SSK3 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TefmQ5SSK3 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TefmQ5SSK3 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TefmQ5SSK3 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TefmQ5SSK3 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TefmQ5SSK3 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TefmQ5SSK3 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TefmQ5SSK3 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TefmQ5SSK3 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TefmQ5SSK3 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TefmQ5SSK3 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TefmQ5SSK3 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TefmQ5SSK3 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TefmQ5SSK3 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TefmQ5SSK3 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
TefmQ5SSK3 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TefmQ5SSK3 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TefmQ5SSK3 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TefmQ5SSK3 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TefmQ5SSK3 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TefmQ5SSK3 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TefmQ5SSK3 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TefmQ5SSK3 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TefmQ5SSK3 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TefmQ5SSK3 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TefmQ5SSK3 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TefmQ5SSK3 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TefmQ5SSK3 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TefmQ5SSK3 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TefmQ5SSK3 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TefmQ5SSK3 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 203 ms