Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPW0

Vps54, Vacuolar protein sorting-associated protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps54Q5SPW0 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vps54Q5SPW0 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vps54Q5SPW0 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vps54Q5SPW0 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vps54Q5SPW0 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vps54Q5SPW0 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vps54Q5SPW0 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Vps54Q5SPW0 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vps54Q5SPW0 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vps54Q5SPW0 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vps54Q5SPW0 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vps54Q5SPW0 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vps54Q5SPW0 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vps54Q5SPW0 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vps54Q5SPW0 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vps54Q5SPW0 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vps54Q5SPW0 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vps54Q5SPW0 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vps54Q5SPW0 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vps54Q5SPW0 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vps54Q5SPW0 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vps54Q5SPW0 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vps54Q5SPW0 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vps54Q5SPW0 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vps54Q5SPW0 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vps54Q5SPW0 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vps54Q5SPW0 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vps54Q5SPW0 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vps54Q5SPW0 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vps54Q5SPW0 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vps54Q5SPW0 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vps54Q5SPW0 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vps54Q5SPW0 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Vps54Q5SPW0 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Vps54Q5SPW0 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vps54Q5SPW0 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vps54Q5SPW0 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vps54Q5SPW0 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vps54Q5SPW0 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vps54Q5SPW0 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vps54Q5SPW0 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vps54Q5SPW0 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vps54Q5SPW0 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vps54Q5SPW0 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vps54Q5SPW0 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vps54Q5SPW0 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vps54Q5SPW0 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vps54Q5SPW0 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vps54Q5SPW0 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Vps54Q5SPW0 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Vps54Q5SPW0 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vps54Q5SPW0 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vps54Q5SPW0 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vps54Q5SPW0 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vps54Q5SPW0 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vps54Q5SPW0 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vps54Q5SPW0 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vps54Q5SPW0 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vps54Q5SPW0 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vps54Q5SPW0 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Vps54Q5SPW0 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vps54Q5SPW0 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Vps54Q5SPW0 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vps54Q5SPW0 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vps54Q5SPW0 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vps54Q5SPW0 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vps54Q5SPW0 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vps54Q5SPW0 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vps54Q5SPW0 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vps54Q5SPW0 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vps54Q5SPW0 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vps54Q5SPW0 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vps54Q5SPW0 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vps54Q5SPW0 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vps54Q5SPW0 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vps54Q5SPW0 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vps54Q5SPW0 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vps54Q5SPW0 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vps54Q5SPW0 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vps54Q5SPW0 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vps54Q5SPW0 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vps54Q5SPW0 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vps54Q5SPW0 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vps54Q5SPW0 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vps54Q5SPW0 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vps54Q5SPW0 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Vps54Q5SPW0 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vps54Q5SPW0 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vps54Q5SPW0 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vps54Q5SPW0 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vps54Q5SPW0 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vps54Q5SPW0 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vps54Q5SPW0 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vps54Q5SPW0 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vps54Q5SPW0 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vps54Q5SPW0 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Vps54Q5SPW0 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Vps54Q5SPW0 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vps54Q5SPW0 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vps54Q5SPW0 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms