Protein–RNA interactions for Protein: Q5SNZ0

Ccdc88a, Girdin, mousemouse

Predictions only

Length 1,873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88aQ5SNZ0 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc88aQ5SNZ0 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc88aQ5SNZ0 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc88aQ5SNZ0 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc88aQ5SNZ0 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc88aQ5SNZ0 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc88aQ5SNZ0 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc88aQ5SNZ0 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc88aQ5SNZ0 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc88aQ5SNZ0 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc88aQ5SNZ0 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc88aQ5SNZ0 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc88aQ5SNZ0 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc88aQ5SNZ0 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc88aQ5SNZ0 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc88aQ5SNZ0 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc88aQ5SNZ0 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc88aQ5SNZ0 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc88aQ5SNZ0 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc88aQ5SNZ0 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc88aQ5SNZ0 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc88aQ5SNZ0 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc88aQ5SNZ0 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc88aQ5SNZ0 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc88aQ5SNZ0 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc88aQ5SNZ0 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc88aQ5SNZ0 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc88aQ5SNZ0 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc88aQ5SNZ0 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc88aQ5SNZ0 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc88aQ5SNZ0 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc88aQ5SNZ0 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc88aQ5SNZ0 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc88aQ5SNZ0 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc88aQ5SNZ0 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc88aQ5SNZ0 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc88aQ5SNZ0 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc88aQ5SNZ0 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc88aQ5SNZ0 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc88aQ5SNZ0 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc88aQ5SNZ0 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc88aQ5SNZ0 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc88aQ5SNZ0 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc88aQ5SNZ0 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc88aQ5SNZ0 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc88aQ5SNZ0 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc88aQ5SNZ0 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc88aQ5SNZ0 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc88aQ5SNZ0 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc88aQ5SNZ0 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc88aQ5SNZ0 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc88aQ5SNZ0 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc88aQ5SNZ0 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc88aQ5SNZ0 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc88aQ5SNZ0 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc88aQ5SNZ0 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc88aQ5SNZ0 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc88aQ5SNZ0 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc88aQ5SNZ0 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc88aQ5SNZ0 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc88aQ5SNZ0 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc88aQ5SNZ0 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc88aQ5SNZ0 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc88aQ5SNZ0 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc88aQ5SNZ0 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc88aQ5SNZ0 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc88aQ5SNZ0 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc88aQ5SNZ0 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc88aQ5SNZ0 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc88aQ5SNZ0 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc88aQ5SNZ0 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc88aQ5SNZ0 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc88aQ5SNZ0 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc88aQ5SNZ0 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc88aQ5SNZ0 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc88aQ5SNZ0 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc88aQ5SNZ0 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc88aQ5SNZ0 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc88aQ5SNZ0 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc88aQ5SNZ0 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc88aQ5SNZ0 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc88aQ5SNZ0 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc88aQ5SNZ0 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc88aQ5SNZ0 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc88aQ5SNZ0 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms