Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1B6

Trav8d-2, T cell receptor alpha variable 8D-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav8d-2Q5R1B6 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Trav8d-2Q5R1B6 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Trav8d-2Q5R1B6 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trav8d-2Q5R1B6 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trav8d-2Q5R1B6 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trav8d-2Q5R1B6 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trav8d-2Q5R1B6 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trav8d-2Q5R1B6 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trav8d-2Q5R1B6 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trav8d-2Q5R1B6 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trav8d-2Q5R1B6 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Trav8d-2Q5R1B6 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trav8d-2Q5R1B6 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trav8d-2Q5R1B6 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trav8d-2Q5R1B6 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trav8d-2Q5R1B6 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trav8d-2Q5R1B6 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trav8d-2Q5R1B6 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trav8d-2Q5R1B6 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trav8d-2Q5R1B6 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trav8d-2Q5R1B6 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trav8d-2Q5R1B6 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trav8d-2Q5R1B6 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trav8d-2Q5R1B6 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trav8d-2Q5R1B6 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trav8d-2Q5R1B6 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trav8d-2Q5R1B6 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trav8d-2Q5R1B6 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trav8d-2Q5R1B6 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trav8d-2Q5R1B6 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trav8d-2Q5R1B6 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trav8d-2Q5R1B6 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trav8d-2Q5R1B6 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Trav8d-2Q5R1B6 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trav8d-2Q5R1B6 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trav8d-2Q5R1B6 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trav8d-2Q5R1B6 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trav8d-2Q5R1B6 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trav8d-2Q5R1B6 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trav8d-2Q5R1B6 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trav8d-2Q5R1B6 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trav8d-2Q5R1B6 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trav8d-2Q5R1B6 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trav8d-2Q5R1B6 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Trav8d-2Q5R1B6 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trav8d-2Q5R1B6 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trav8d-2Q5R1B6 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trav8d-2Q5R1B6 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trav8d-2Q5R1B6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trav8d-2Q5R1B6 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trav8d-2Q5R1B6 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trav8d-2Q5R1B6 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trav8d-2Q5R1B6 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trav8d-2Q5R1B6 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trav8d-2Q5R1B6 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trav8d-2Q5R1B6 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trav8d-2Q5R1B6 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trav8d-2Q5R1B6 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trav8d-2Q5R1B6 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Trav8d-2Q5R1B6 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Trav8d-2Q5R1B6 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trav8d-2Q5R1B6 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trav8d-2Q5R1B6 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trav8d-2Q5R1B6 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trav8d-2Q5R1B6 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trav8d-2Q5R1B6 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trav8d-2Q5R1B6 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trav8d-2Q5R1B6 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trav8d-2Q5R1B6 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trav8d-2Q5R1B6 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trav8d-2Q5R1B6 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trav8d-2Q5R1B6 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trav8d-2Q5R1B6 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trav8d-2Q5R1B6 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trav8d-2Q5R1B6 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trav8d-2Q5R1B6 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Trav8d-2Q5R1B6 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trav8d-2Q5R1B6 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trav8d-2Q5R1B6 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trav8d-2Q5R1B6 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trav8d-2Q5R1B6 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trav8d-2Q5R1B6 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trav8d-2Q5R1B6 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trav8d-2Q5R1B6 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trav8d-2Q5R1B6 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trav8d-2Q5R1B6 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trav8d-2Q5R1B6 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trav8d-2Q5R1B6 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trav8d-2Q5R1B6 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trav8d-2Q5R1B6 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trav8d-2Q5R1B6 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trav8d-2Q5R1B6 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trav8d-2Q5R1B6 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Trav8d-2Q5R1B6 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trav8d-2Q5R1B6 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trav8d-2Q5R1B6 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trav8d-2Q5R1B6 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trav8d-2Q5R1B6 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trav8d-2Q5R1B6 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trav8d-2Q5R1B6 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms