Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCB3

Gm5431, Predicted gene 5431, mousemouse

Predictions only

Length 844 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5431Q5NCB3 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm5431Q5NCB3 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm5431Q5NCB3 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm5431Q5NCB3 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm5431Q5NCB3 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm5431Q5NCB3 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm5431Q5NCB3 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm5431Q5NCB3 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm5431Q5NCB3 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm5431Q5NCB3 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm5431Q5NCB3 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm5431Q5NCB3 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm5431Q5NCB3 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm5431Q5NCB3 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm5431Q5NCB3 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm5431Q5NCB3 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm5431Q5NCB3 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm5431Q5NCB3 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm5431Q5NCB3 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm5431Q5NCB3 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm5431Q5NCB3 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm5431Q5NCB3 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm5431Q5NCB3 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm5431Q5NCB3 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm5431Q5NCB3 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm5431Q5NCB3 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm5431Q5NCB3 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm5431Q5NCB3 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm5431Q5NCB3 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm5431Q5NCB3 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm5431Q5NCB3 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm5431Q5NCB3 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm5431Q5NCB3 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm5431Q5NCB3 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm5431Q5NCB3 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm5431Q5NCB3 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm5431Q5NCB3 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm5431Q5NCB3 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm5431Q5NCB3 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm5431Q5NCB3 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm5431Q5NCB3 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm5431Q5NCB3 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm5431Q5NCB3 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm5431Q5NCB3 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm5431Q5NCB3 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm5431Q5NCB3 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm5431Q5NCB3 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm5431Q5NCB3 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm5431Q5NCB3 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm5431Q5NCB3 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm5431Q5NCB3 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm5431Q5NCB3 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm5431Q5NCB3 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm5431Q5NCB3 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm5431Q5NCB3 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm5431Q5NCB3 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm5431Q5NCB3 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm5431Q5NCB3 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm5431Q5NCB3 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm5431Q5NCB3 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm5431Q5NCB3 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm5431Q5NCB3 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm5431Q5NCB3 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm5431Q5NCB3 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm5431Q5NCB3 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm5431Q5NCB3 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm5431Q5NCB3 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm5431Q5NCB3 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm5431Q5NCB3 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm5431Q5NCB3 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm5431Q5NCB3 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm5431Q5NCB3 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm5431Q5NCB3 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm5431Q5NCB3 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm5431Q5NCB3 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm5431Q5NCB3 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm5431Q5NCB3 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm5431Q5NCB3 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm5431Q5NCB3 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm5431Q5NCB3 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm5431Q5NCB3 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm5431Q5NCB3 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm5431Q5NCB3 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm5431Q5NCB3 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm5431Q5NCB3 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm5431Q5NCB3 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm5431Q5NCB3 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm5431Q5NCB3 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm5431Q5NCB3 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm5431Q5NCB3 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm5431Q5NCB3 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm5431Q5NCB3 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm5431Q5NCB3 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm5431Q5NCB3 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm5431Q5NCB3 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm5431Q5NCB3 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm5431Q5NCB3 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm5431Q5NCB3 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm5431Q5NCB3 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm5431Q5NCB3 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.8 ms