Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC05

Ttf2, Transcription termination factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf2Q5NC05 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ttf2Q5NC05 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ttf2Q5NC05 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Ttf2Q5NC05 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Ttf2Q5NC05 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Ttf2Q5NC05 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Ttf2Q5NC05 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ttf2Q5NC05 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ttf2Q5NC05 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ttf2Q5NC05 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ttf2Q5NC05 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ttf2Q5NC05 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ttf2Q5NC05 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ttf2Q5NC05 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ttf2Q5NC05 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ttf2Q5NC05 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ttf2Q5NC05 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Ttf2Q5NC05 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ttf2Q5NC05 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ttf2Q5NC05 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ttf2Q5NC05 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ttf2Q5NC05 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ttf2Q5NC05 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ttf2Q5NC05 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ttf2Q5NC05 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ttf2Q5NC05 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ttf2Q5NC05 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ttf2Q5NC05 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ttf2Q5NC05 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ttf2Q5NC05 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ttf2Q5NC05 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ttf2Q5NC05 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ttf2Q5NC05 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ttf2Q5NC05 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ttf2Q5NC05 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ttf2Q5NC05 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ttf2Q5NC05 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ttf2Q5NC05 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ttf2Q5NC05 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ttf2Q5NC05 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ttf2Q5NC05 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ttf2Q5NC05 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ttf2Q5NC05 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ttf2Q5NC05 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC19.64■□□□□ 0.74
Ttf2Q5NC05 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Ttf2Q5NC05 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ttf2Q5NC05 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ttf2Q5NC05 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ttf2Q5NC05 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ttf2Q5NC05 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ttf2Q5NC05 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ttf2Q5NC05 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ttf2Q5NC05 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ttf2Q5NC05 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ttf2Q5NC05 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ttf2Q5NC05 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ttf2Q5NC05 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ttf2Q5NC05 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ttf2Q5NC05 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ttf2Q5NC05 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ttf2Q5NC05 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ttf2Q5NC05 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ttf2Q5NC05 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ttf2Q5NC05 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ttf2Q5NC05 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ttf2Q5NC05 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ttf2Q5NC05 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ttf2Q5NC05 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ttf2Q5NC05 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ttf2Q5NC05 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ttf2Q5NC05 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ttf2Q5NC05 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ttf2Q5NC05 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ttf2Q5NC05 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ttf2Q5NC05 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ttf2Q5NC05 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Ttf2Q5NC05 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ttf2Q5NC05 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ttf2Q5NC05 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ttf2Q5NC05 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ttf2Q5NC05 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Ttf2Q5NC05 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ttf2Q5NC05 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ttf2Q5NC05 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ttf2Q5NC05 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ttf2Q5NC05 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ttf2Q5NC05 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ttf2Q5NC05 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ttf2Q5NC05 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ttf2Q5NC05 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ttf2Q5NC05 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ttf2Q5NC05 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ttf2Q5NC05 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ttf2Q5NC05 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ttf2Q5NC05 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ttf2Q5NC05 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ttf2Q5NC05 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ttf2Q5NC05 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Ttf2Q5NC05 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Ttf2Q5NC05 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms