Protein–RNA interactions for Protein: Q5HZG4

Taf3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf3Q5HZG4 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Taf3Q5HZG4 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Taf3Q5HZG4 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Taf3Q5HZG4 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Taf3Q5HZG4 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Taf3Q5HZG4 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Taf3Q5HZG4 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Taf3Q5HZG4 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Taf3Q5HZG4 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Taf3Q5HZG4 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Taf3Q5HZG4 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Taf3Q5HZG4 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Taf3Q5HZG4 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Taf3Q5HZG4 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Taf3Q5HZG4 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Taf3Q5HZG4 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Taf3Q5HZG4 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Taf3Q5HZG4 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Taf3Q5HZG4 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Taf3Q5HZG4 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Taf3Q5HZG4 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Taf3Q5HZG4 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Taf3Q5HZG4 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Taf3Q5HZG4 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Taf3Q5HZG4 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Taf3Q5HZG4 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Taf3Q5HZG4 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Taf3Q5HZG4 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Taf3Q5HZG4 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Taf3Q5HZG4 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Taf3Q5HZG4 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Taf3Q5HZG4 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Taf3Q5HZG4 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Taf3Q5HZG4 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Taf3Q5HZG4 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Taf3Q5HZG4 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Taf3Q5HZG4 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Taf3Q5HZG4 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Taf3Q5HZG4 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Taf3Q5HZG4 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Taf3Q5HZG4 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Taf3Q5HZG4 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Taf3Q5HZG4 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Taf3Q5HZG4 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Taf3Q5HZG4 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Taf3Q5HZG4 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Taf3Q5HZG4 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Taf3Q5HZG4 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Taf3Q5HZG4 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Taf3Q5HZG4 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Taf3Q5HZG4 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Taf3Q5HZG4 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Taf3Q5HZG4 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Taf3Q5HZG4 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Taf3Q5HZG4 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Taf3Q5HZG4 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Taf3Q5HZG4 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Taf3Q5HZG4 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Taf3Q5HZG4 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Taf3Q5HZG4 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Taf3Q5HZG4 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Taf3Q5HZG4 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Taf3Q5HZG4 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Taf3Q5HZG4 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Taf3Q5HZG4 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Taf3Q5HZG4 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Taf3Q5HZG4 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Taf3Q5HZG4 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Taf3Q5HZG4 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Taf3Q5HZG4 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Taf3Q5HZG4 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Taf3Q5HZG4 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Taf3Q5HZG4 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Taf3Q5HZG4 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Taf3Q5HZG4 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Taf3Q5HZG4 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Taf3Q5HZG4 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Taf3Q5HZG4 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Taf3Q5HZG4 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Taf3Q5HZG4 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Taf3Q5HZG4 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Taf3Q5HZG4 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Taf3Q5HZG4 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Taf3Q5HZG4 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Taf3Q5HZG4 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Taf3Q5HZG4 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Taf3Q5HZG4 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Taf3Q5HZG4 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Taf3Q5HZG4 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Taf3Q5HZG4 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Taf3Q5HZG4 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Taf3Q5HZG4 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Taf3Q5HZG4 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Taf3Q5HZG4 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Taf3Q5HZG4 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Taf3Q5HZG4 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Taf3Q5HZG4 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Taf3Q5HZG4 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Taf3Q5HZG4 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Taf3Q5HZG4 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms