Protein–RNA interactions for Protein: Q5GIG6

Tnni3k, Serine/threonine-protein kinase TNNI3K, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3kQ5GIG6 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tnni3kQ5GIG6 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tnni3kQ5GIG6 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Tnni3kQ5GIG6 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Tnni3kQ5GIG6 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Tnni3kQ5GIG6 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Tnni3kQ5GIG6 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Tnni3kQ5GIG6 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Tnni3kQ5GIG6 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Tnni3kQ5GIG6 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tnni3kQ5GIG6 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tnni3kQ5GIG6 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tnni3kQ5GIG6 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tnni3kQ5GIG6 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Tnni3kQ5GIG6 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tnni3kQ5GIG6 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tnni3kQ5GIG6 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tnni3kQ5GIG6 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tnni3kQ5GIG6 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tnni3kQ5GIG6 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tnni3kQ5GIG6 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tnni3kQ5GIG6 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tnni3kQ5GIG6 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tnni3kQ5GIG6 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tnni3kQ5GIG6 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tnni3kQ5GIG6 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Tnni3kQ5GIG6 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tnni3kQ5GIG6 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tnni3kQ5GIG6 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tnni3kQ5GIG6 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tnni3kQ5GIG6 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tnni3kQ5GIG6 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tnni3kQ5GIG6 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Tnni3kQ5GIG6 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tnni3kQ5GIG6 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tnni3kQ5GIG6 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tnni3kQ5GIG6 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Tnni3kQ5GIG6 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tnni3kQ5GIG6 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tnni3kQ5GIG6 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tnni3kQ5GIG6 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tnni3kQ5GIG6 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Tnni3kQ5GIG6 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tnni3kQ5GIG6 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tnni3kQ5GIG6 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tnni3kQ5GIG6 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tnni3kQ5GIG6 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tnni3kQ5GIG6 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tnni3kQ5GIG6 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tnni3kQ5GIG6 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tnni3kQ5GIG6 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tnni3kQ5GIG6 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tnni3kQ5GIG6 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tnni3kQ5GIG6 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tnni3kQ5GIG6 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tnni3kQ5GIG6 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tnni3kQ5GIG6 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tnni3kQ5GIG6 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tnni3kQ5GIG6 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tnni3kQ5GIG6 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Tnni3kQ5GIG6 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tnni3kQ5GIG6 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tnni3kQ5GIG6 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tnni3kQ5GIG6 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tnni3kQ5GIG6 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tnni3kQ5GIG6 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Tnni3kQ5GIG6 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tnni3kQ5GIG6 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Tnni3kQ5GIG6 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tnni3kQ5GIG6 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tnni3kQ5GIG6 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tnni3kQ5GIG6 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tnni3kQ5GIG6 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tnni3kQ5GIG6 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tnni3kQ5GIG6 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tnni3kQ5GIG6 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tnni3kQ5GIG6 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tnni3kQ5GIG6 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tnni3kQ5GIG6 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tnni3kQ5GIG6 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tnni3kQ5GIG6 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tnni3kQ5GIG6 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tnni3kQ5GIG6 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tnni3kQ5GIG6 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tnni3kQ5GIG6 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tnni3kQ5GIG6 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tnni3kQ5GIG6 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tnni3kQ5GIG6 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tnni3kQ5GIG6 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tnni3kQ5GIG6 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tnni3kQ5GIG6 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tnni3kQ5GIG6 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tnni3kQ5GIG6 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Tnni3kQ5GIG6 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tnni3kQ5GIG6 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tnni3kQ5GIG6 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tnni3kQ5GIG6 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tnni3kQ5GIG6 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tnni3kQ5GIG6 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tnni3kQ5GIG6 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms