Protein–RNA interactions for Protein: Q571G4

Lin54, Protein lin-54 homolog, mousemouse

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Length 749 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin54Q571G4 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Lin54Q571G4 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lin54Q571G4 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lin54Q571G4 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lin54Q571G4 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lin54Q571G4 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Lin54Q571G4 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lin54Q571G4 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lin54Q571G4 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lin54Q571G4 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lin54Q571G4 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Lin54Q571G4 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lin54Q571G4 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Lin54Q571G4 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Lin54Q571G4 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lin54Q571G4 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lin54Q571G4 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lin54Q571G4 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lin54Q571G4 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lin54Q571G4 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Lin54Q571G4 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lin54Q571G4 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lin54Q571G4 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lin54Q571G4 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lin54Q571G4 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lin54Q571G4 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lin54Q571G4 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lin54Q571G4 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lin54Q571G4 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lin54Q571G4 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Lin54Q571G4 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lin54Q571G4 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lin54Q571G4 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lin54Q571G4 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Lin54Q571G4 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lin54Q571G4 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lin54Q571G4 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Lin54Q571G4 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lin54Q571G4 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lin54Q571G4 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Lin54Q571G4 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Lin54Q571G4 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lin54Q571G4 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lin54Q571G4 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lin54Q571G4 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lin54Q571G4 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lin54Q571G4 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lin54Q571G4 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lin54Q571G4 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Lin54Q571G4 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lin54Q571G4 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lin54Q571G4 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lin54Q571G4 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lin54Q571G4 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lin54Q571G4 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lin54Q571G4 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lin54Q571G4 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lin54Q571G4 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lin54Q571G4 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lin54Q571G4 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lin54Q571G4 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lin54Q571G4 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lin54Q571G4 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lin54Q571G4 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lin54Q571G4 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lin54Q571G4 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Lin54Q571G4 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lin54Q571G4 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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