Protein–RNA interactions for Protein: Q52KE7

Ccnl1, Cyclin-L1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnl1Q52KE7 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccnl1Q52KE7 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccnl1Q52KE7 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccnl1Q52KE7 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccnl1Q52KE7 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccnl1Q52KE7 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccnl1Q52KE7 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccnl1Q52KE7 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccnl1Q52KE7 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccnl1Q52KE7 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccnl1Q52KE7 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccnl1Q52KE7 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccnl1Q52KE7 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccnl1Q52KE7 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccnl1Q52KE7 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccnl1Q52KE7 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccnl1Q52KE7 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccnl1Q52KE7 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccnl1Q52KE7 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccnl1Q52KE7 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ccnl1Q52KE7 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccnl1Q52KE7 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccnl1Q52KE7 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccnl1Q52KE7 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccnl1Q52KE7 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccnl1Q52KE7 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccnl1Q52KE7 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccnl1Q52KE7 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccnl1Q52KE7 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccnl1Q52KE7 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccnl1Q52KE7 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccnl1Q52KE7 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccnl1Q52KE7 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccnl1Q52KE7 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccnl1Q52KE7 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccnl1Q52KE7 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccnl1Q52KE7 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccnl1Q52KE7 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccnl1Q52KE7 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccnl1Q52KE7 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccnl1Q52KE7 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccnl1Q52KE7 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccnl1Q52KE7 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccnl1Q52KE7 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccnl1Q52KE7 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccnl1Q52KE7 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccnl1Q52KE7 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccnl1Q52KE7 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccnl1Q52KE7 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccnl1Q52KE7 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccnl1Q52KE7 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccnl1Q52KE7 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccnl1Q52KE7 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccnl1Q52KE7 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccnl1Q52KE7 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccnl1Q52KE7 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccnl1Q52KE7 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccnl1Q52KE7 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccnl1Q52KE7 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccnl1Q52KE7 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccnl1Q52KE7 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccnl1Q52KE7 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccnl1Q52KE7 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccnl1Q52KE7 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccnl1Q52KE7 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccnl1Q52KE7 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccnl1Q52KE7 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccnl1Q52KE7 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccnl1Q52KE7 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccnl1Q52KE7 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccnl1Q52KE7 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccnl1Q52KE7 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccnl1Q52KE7 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccnl1Q52KE7 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccnl1Q52KE7 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccnl1Q52KE7 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccnl1Q52KE7 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccnl1Q52KE7 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccnl1Q52KE7 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccnl1Q52KE7 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccnl1Q52KE7 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccnl1Q52KE7 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccnl1Q52KE7 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccnl1Q52KE7 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccnl1Q52KE7 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccnl1Q52KE7 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccnl1Q52KE7 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccnl1Q52KE7 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccnl1Q52KE7 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccnl1Q52KE7 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccnl1Q52KE7 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccnl1Q52KE7 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccnl1Q52KE7 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccnl1Q52KE7 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccnl1Q52KE7 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccnl1Q52KE7 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccnl1Q52KE7 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccnl1Q52KE7 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccnl1Q52KE7 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccnl1Q52KE7 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms