Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL14

Trappc3l, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3lQ4KL14 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trappc3lQ4KL14 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trappc3lQ4KL14 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trappc3lQ4KL14 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trappc3lQ4KL14 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trappc3lQ4KL14 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trappc3lQ4KL14 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trappc3lQ4KL14 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trappc3lQ4KL14 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trappc3lQ4KL14 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trappc3lQ4KL14 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trappc3lQ4KL14 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trappc3lQ4KL14 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trappc3lQ4KL14 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trappc3lQ4KL14 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trappc3lQ4KL14 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trappc3lQ4KL14 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trappc3lQ4KL14 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trappc3lQ4KL14 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trappc3lQ4KL14 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trappc3lQ4KL14 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trappc3lQ4KL14 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trappc3lQ4KL14 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trappc3lQ4KL14 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trappc3lQ4KL14 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trappc3lQ4KL14 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trappc3lQ4KL14 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trappc3lQ4KL14 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trappc3lQ4KL14 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trappc3lQ4KL14 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trappc3lQ4KL14 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trappc3lQ4KL14 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trappc3lQ4KL14 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trappc3lQ4KL14 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trappc3lQ4KL14 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trappc3lQ4KL14 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trappc3lQ4KL14 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trappc3lQ4KL14 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trappc3lQ4KL14 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trappc3lQ4KL14 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trappc3lQ4KL14 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trappc3lQ4KL14 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trappc3lQ4KL14 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trappc3lQ4KL14 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trappc3lQ4KL14 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trappc3lQ4KL14 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trappc3lQ4KL14 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trappc3lQ4KL14 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trappc3lQ4KL14 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trappc3lQ4KL14 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trappc3lQ4KL14 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trappc3lQ4KL14 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trappc3lQ4KL14 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trappc3lQ4KL14 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trappc3lQ4KL14 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trappc3lQ4KL14 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Trappc3lQ4KL14 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trappc3lQ4KL14 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trappc3lQ4KL14 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trappc3lQ4KL14 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trappc3lQ4KL14 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trappc3lQ4KL14 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trappc3lQ4KL14 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trappc3lQ4KL14 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trappc3lQ4KL14 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trappc3lQ4KL14 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Trappc3lQ4KL14 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trappc3lQ4KL14 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trappc3lQ4KL14 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trappc3lQ4KL14 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trappc3lQ4KL14 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trappc3lQ4KL14 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Trappc3lQ4KL14 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Trappc3lQ4KL14 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trappc3lQ4KL14 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trappc3lQ4KL14 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trappc3lQ4KL14 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trappc3lQ4KL14 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trappc3lQ4KL14 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trappc3lQ4KL14 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trappc3lQ4KL14 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trappc3lQ4KL14 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trappc3lQ4KL14 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trappc3lQ4KL14 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trappc3lQ4KL14 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trappc3lQ4KL14 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Trappc3lQ4KL14 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trappc3lQ4KL14 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trappc3lQ4KL14 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trappc3lQ4KL14 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trappc3lQ4KL14 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trappc3lQ4KL14 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trappc3lQ4KL14 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trappc3lQ4KL14 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trappc3lQ4KL14 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trappc3lQ4KL14 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trappc3lQ4KL14 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trappc3lQ4KL14 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trappc3lQ4KL14 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trappc3lQ4KL14 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms