Protein–RNA interactions for Protein: Q3V129

Ulk4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, mousemouse

Predictions only

Length 1,303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk4Q3V129 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ulk4Q3V129 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ulk4Q3V129 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ulk4Q3V129 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ulk4Q3V129 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ulk4Q3V129 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ulk4Q3V129 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ulk4Q3V129 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ulk4Q3V129 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ulk4Q3V129 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ulk4Q3V129 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ulk4Q3V129 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ulk4Q3V129 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ulk4Q3V129 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ulk4Q3V129 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ulk4Q3V129 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ulk4Q3V129 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ulk4Q3V129 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ulk4Q3V129 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ulk4Q3V129 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ulk4Q3V129 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ulk4Q3V129 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ulk4Q3V129 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ulk4Q3V129 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ulk4Q3V129 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ulk4Q3V129 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ulk4Q3V129 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ulk4Q3V129 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ulk4Q3V129 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ulk4Q3V129 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ulk4Q3V129 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ulk4Q3V129 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ulk4Q3V129 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ulk4Q3V129 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ulk4Q3V129 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ulk4Q3V129 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ulk4Q3V129 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ulk4Q3V129 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Ulk4Q3V129 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ulk4Q3V129 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ulk4Q3V129 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ulk4Q3V129 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ulk4Q3V129 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ulk4Q3V129 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ulk4Q3V129 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ulk4Q3V129 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Ulk4Q3V129 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ulk4Q3V129 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ulk4Q3V129 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ulk4Q3V129 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ulk4Q3V129 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ulk4Q3V129 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ulk4Q3V129 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ulk4Q3V129 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ulk4Q3V129 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ulk4Q3V129 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ulk4Q3V129 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ulk4Q3V129 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ulk4Q3V129 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ulk4Q3V129 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ulk4Q3V129 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ulk4Q3V129 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Ulk4Q3V129 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ulk4Q3V129 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Ulk4Q3V129 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ulk4Q3V129 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ulk4Q3V129 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ulk4Q3V129 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ulk4Q3V129 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ulk4Q3V129 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ulk4Q3V129 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ulk4Q3V129 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ulk4Q3V129 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Ulk4Q3V129 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Ulk4Q3V129 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Ulk4Q3V129 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ulk4Q3V129 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ulk4Q3V129 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Ulk4Q3V129 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ulk4Q3V129 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ulk4Q3V129 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ulk4Q3V129 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ulk4Q3V129 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ulk4Q3V129 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ulk4Q3V129 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ulk4Q3V129 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Ulk4Q3V129 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ulk4Q3V129 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Ulk4Q3V129 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ulk4Q3V129 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ulk4Q3V129 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ulk4Q3V129 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ulk4Q3V129 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ulk4Q3V129 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ulk4Q3V129 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ulk4Q3V129 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ulk4Q3V129 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ulk4Q3V129 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ulk4Q3V129 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Ulk4Q3V129 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms