Protein–RNA interactions for Protein: Q3V118

Ccdc185, Coiled-coil domain-containing 185, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc185Q3V118 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc185Q3V118 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc185Q3V118 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc185Q3V118 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc185Q3V118 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc185Q3V118 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc185Q3V118 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc185Q3V118 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc185Q3V118 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc185Q3V118 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc185Q3V118 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc185Q3V118 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc185Q3V118 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc185Q3V118 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc185Q3V118 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc185Q3V118 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc185Q3V118 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc185Q3V118 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc185Q3V118 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc185Q3V118 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc185Q3V118 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc185Q3V118 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc185Q3V118 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc185Q3V118 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc185Q3V118 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc185Q3V118 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc185Q3V118 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc185Q3V118 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc185Q3V118 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc185Q3V118 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc185Q3V118 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc185Q3V118 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc185Q3V118 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc185Q3V118 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc185Q3V118 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc185Q3V118 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc185Q3V118 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc185Q3V118 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc185Q3V118 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc185Q3V118 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc185Q3V118 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc185Q3V118 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc185Q3V118 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc185Q3V118 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc185Q3V118 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc185Q3V118 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc185Q3V118 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc185Q3V118 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc185Q3V118 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc185Q3V118 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc185Q3V118 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc185Q3V118 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc185Q3V118 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc185Q3V118 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc185Q3V118 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc185Q3V118 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc185Q3V118 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc185Q3V118 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc185Q3V118 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc185Q3V118 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc185Q3V118 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc185Q3V118 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc185Q3V118 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc185Q3V118 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc185Q3V118 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc185Q3V118 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc185Q3V118 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc185Q3V118 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc185Q3V118 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc185Q3V118 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc185Q3V118 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc185Q3V118 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc185Q3V118 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc185Q3V118 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc185Q3V118 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc185Q3V118 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc185Q3V118 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc185Q3V118 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc185Q3V118 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc185Q3V118 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc185Q3V118 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc185Q3V118 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc185Q3V118 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc185Q3V118 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc185Q3V118 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc185Q3V118 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc185Q3V118 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc185Q3V118 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc185Q3V118 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc185Q3V118 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc185Q3V118 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc185Q3V118 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc185Q3V118 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc185Q3V118 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc185Q3V118 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc185Q3V118 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc185Q3V118 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc185Q3V118 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc185Q3V118 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc185Q3V118 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms