Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0J4

Ankrd53, Ankyrin repeat domain-containing protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd53Q3V0J4 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ankrd53Q3V0J4 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ankrd53Q3V0J4 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ankrd53Q3V0J4 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ankrd53Q3V0J4 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ankrd53Q3V0J4 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ankrd53Q3V0J4 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ankrd53Q3V0J4 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ankrd53Q3V0J4 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ankrd53Q3V0J4 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ankrd53Q3V0J4 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ankrd53Q3V0J4 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ankrd53Q3V0J4 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ankrd53Q3V0J4 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ankrd53Q3V0J4 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ankrd53Q3V0J4 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ankrd53Q3V0J4 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ankrd53Q3V0J4 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ankrd53Q3V0J4 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ankrd53Q3V0J4 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ankrd53Q3V0J4 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ankrd53Q3V0J4 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ankrd53Q3V0J4 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ankrd53Q3V0J4 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ankrd53Q3V0J4 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ankrd53Q3V0J4 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ankrd53Q3V0J4 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ankrd53Q3V0J4 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ankrd53Q3V0J4 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ankrd53Q3V0J4 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ankrd53Q3V0J4 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ankrd53Q3V0J4 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ankrd53Q3V0J4 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ankrd53Q3V0J4 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ankrd53Q3V0J4 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ankrd53Q3V0J4 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ankrd53Q3V0J4 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ankrd53Q3V0J4 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ankrd53Q3V0J4 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ankrd53Q3V0J4 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ankrd53Q3V0J4 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ankrd53Q3V0J4 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ankrd53Q3V0J4 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ankrd53Q3V0J4 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ankrd53Q3V0J4 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ankrd53Q3V0J4 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ankrd53Q3V0J4 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ankrd53Q3V0J4 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ankrd53Q3V0J4 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ankrd53Q3V0J4 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ankrd53Q3V0J4 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ankrd53Q3V0J4 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ankrd53Q3V0J4 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ankrd53Q3V0J4 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ankrd53Q3V0J4 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ankrd53Q3V0J4 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ankrd53Q3V0J4 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ankrd53Q3V0J4 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ankrd53Q3V0J4 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ankrd53Q3V0J4 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ankrd53Q3V0J4 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ankrd53Q3V0J4 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ankrd53Q3V0J4 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ankrd53Q3V0J4 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ankrd53Q3V0J4 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ankrd53Q3V0J4 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ankrd53Q3V0J4 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ankrd53Q3V0J4 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ankrd53Q3V0J4 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ankrd53Q3V0J4 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ankrd53Q3V0J4 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Ankrd53Q3V0J4 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ankrd53Q3V0J4 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ankrd53Q3V0J4 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ankrd53Q3V0J4 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ankrd53Q3V0J4 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ankrd53Q3V0J4 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ankrd53Q3V0J4 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ankrd53Q3V0J4 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ankrd53Q3V0J4 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ankrd53Q3V0J4 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ankrd53Q3V0J4 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ankrd53Q3V0J4 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ankrd53Q3V0J4 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ankrd53Q3V0J4 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ankrd53Q3V0J4 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ankrd53Q3V0J4 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ankrd53Q3V0J4 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ankrd53Q3V0J4 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ankrd53Q3V0J4 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ankrd53Q3V0J4 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ankrd53Q3V0J4 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ankrd53Q3V0J4 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ankrd53Q3V0J4 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ankrd53Q3V0J4 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ankrd53Q3V0J4 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ankrd53Q3V0J4 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ankrd53Q3V0J4 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ankrd53Q3V0J4 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ankrd53Q3V0J4 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms