Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0H9

4930596D02Rik, RIKEN cDNA 4930596D02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930596D02RikQ3V0H9 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
4930596D02RikQ3V0H9 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
4930596D02RikQ3V0H9 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
4930596D02RikQ3V0H9 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
4930596D02RikQ3V0H9 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
4930596D02RikQ3V0H9 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
4930596D02RikQ3V0H9 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
4930596D02RikQ3V0H9 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
4930596D02RikQ3V0H9 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
4930596D02RikQ3V0H9 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
4930596D02RikQ3V0H9 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
4930596D02RikQ3V0H9 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
4930596D02RikQ3V0H9 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
4930596D02RikQ3V0H9 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
4930596D02RikQ3V0H9 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
4930596D02RikQ3V0H9 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
4930596D02RikQ3V0H9 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
4930596D02RikQ3V0H9 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
4930596D02RikQ3V0H9 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
4930596D02RikQ3V0H9 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
4930596D02RikQ3V0H9 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
4930596D02RikQ3V0H9 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
4930596D02RikQ3V0H9 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
4930596D02RikQ3V0H9 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
4930596D02RikQ3V0H9 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
4930596D02RikQ3V0H9 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
4930596D02RikQ3V0H9 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
4930596D02RikQ3V0H9 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
4930596D02RikQ3V0H9 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
4930596D02RikQ3V0H9 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
4930596D02RikQ3V0H9 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
4930596D02RikQ3V0H9 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
4930596D02RikQ3V0H9 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
4930596D02RikQ3V0H9 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
4930596D02RikQ3V0H9 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
4930596D02RikQ3V0H9 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
4930596D02RikQ3V0H9 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
4930596D02RikQ3V0H9 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
4930596D02RikQ3V0H9 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
4930596D02RikQ3V0H9 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
4930596D02RikQ3V0H9 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
4930596D02RikQ3V0H9 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
4930596D02RikQ3V0H9 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
4930596D02RikQ3V0H9 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
4930596D02RikQ3V0H9 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
4930596D02RikQ3V0H9 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
4930596D02RikQ3V0H9 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
4930596D02RikQ3V0H9 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
4930596D02RikQ3V0H9 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
4930596D02RikQ3V0H9 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
4930596D02RikQ3V0H9 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
4930596D02RikQ3V0H9 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
4930596D02RikQ3V0H9 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
4930596D02RikQ3V0H9 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
4930596D02RikQ3V0H9 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
4930596D02RikQ3V0H9 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
4930596D02RikQ3V0H9 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
4930596D02RikQ3V0H9 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
4930596D02RikQ3V0H9 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
4930596D02RikQ3V0H9 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
4930596D02RikQ3V0H9 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
4930596D02RikQ3V0H9 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
4930596D02RikQ3V0H9 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
4930596D02RikQ3V0H9 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
4930596D02RikQ3V0H9 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
4930596D02RikQ3V0H9 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
4930596D02RikQ3V0H9 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
4930596D02RikQ3V0H9 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
4930596D02RikQ3V0H9 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
4930596D02RikQ3V0H9 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
4930596D02RikQ3V0H9 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
4930596D02RikQ3V0H9 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
4930596D02RikQ3V0H9 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
4930596D02RikQ3V0H9 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
4930596D02RikQ3V0H9 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
4930596D02RikQ3V0H9 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
4930596D02RikQ3V0H9 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
4930596D02RikQ3V0H9 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
4930596D02RikQ3V0H9 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
4930596D02RikQ3V0H9 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
4930596D02RikQ3V0H9 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
4930596D02RikQ3V0H9 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
4930596D02RikQ3V0H9 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
4930596D02RikQ3V0H9 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
4930596D02RikQ3V0H9 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
4930596D02RikQ3V0H9 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
4930596D02RikQ3V0H9 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
4930596D02RikQ3V0H9 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
4930596D02RikQ3V0H9 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
4930596D02RikQ3V0H9 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
4930596D02RikQ3V0H9 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
4930596D02RikQ3V0H9 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
4930596D02RikQ3V0H9 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
4930596D02RikQ3V0H9 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
4930596D02RikQ3V0H9 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
4930596D02RikQ3V0H9 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
4930596D02RikQ3V0H9 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
4930596D02RikQ3V0H9 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
4930596D02RikQ3V0H9 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
4930596D02RikQ3V0H9 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms