Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp48Q3V0C5 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp48Q3V0C5 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp48Q3V0C5 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp48Q3V0C5 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp48Q3V0C5 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp48Q3V0C5 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp48Q3V0C5 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp48Q3V0C5 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp48Q3V0C5 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp48Q3V0C5 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp48Q3V0C5 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp48Q3V0C5 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp48Q3V0C5 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp48Q3V0C5 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp48Q3V0C5 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp48Q3V0C5 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp48Q3V0C5 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp48Q3V0C5 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp48Q3V0C5 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp48Q3V0C5 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp48Q3V0C5 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp48Q3V0C5 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp48Q3V0C5 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp48Q3V0C5 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp48Q3V0C5 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp48Q3V0C5 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp48Q3V0C5 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp48Q3V0C5 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp48Q3V0C5 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp48Q3V0C5 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp48Q3V0C5 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp48Q3V0C5 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp48Q3V0C5 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp48Q3V0C5 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp48Q3V0C5 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp48Q3V0C5 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp48Q3V0C5 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp48Q3V0C5 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp48Q3V0C5 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp48Q3V0C5 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp48Q3V0C5 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp48Q3V0C5 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp48Q3V0C5 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp48Q3V0C5 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp48Q3V0C5 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp48Q3V0C5 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp48Q3V0C5 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp48Q3V0C5 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp48Q3V0C5 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp48Q3V0C5 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp48Q3V0C5 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp48Q3V0C5 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp48Q3V0C5 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp48Q3V0C5 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp48Q3V0C5 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp48Q3V0C5 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp48Q3V0C5 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp48Q3V0C5 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp48Q3V0C5 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp48Q3V0C5 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp48Q3V0C5 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp48Q3V0C5 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp48Q3V0C5 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp48Q3V0C5 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp48Q3V0C5 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp48Q3V0C5 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp48Q3V0C5 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp48Q3V0C5 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp48Q3V0C5 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp48Q3V0C5 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp48Q3V0C5 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp48Q3V0C5 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp48Q3V0C5 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp48Q3V0C5 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp48Q3V0C5 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp48Q3V0C5 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp48Q3V0C5 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp48Q3V0C5 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp48Q3V0C5 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp48Q3V0C5 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp48Q3V0C5 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp48Q3V0C5 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp48Q3V0C5 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp48Q3V0C5 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp48Q3V0C5 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp48Q3V0C5 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp48Q3V0C5 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp48Q3V0C5 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp48Q3V0C5 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp48Q3V0C5 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp48Q3V0C5 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp48Q3V0C5 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp48Q3V0C5 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp48Q3V0C5 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp48Q3V0C5 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp48Q3V0C5 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp48Q3V0C5 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp48Q3V0C5 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp48Q3V0C5 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms