Protein–RNA interactions for Protein: Q3V096

Ankrd42, Ankyrin repeat domain-containing protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd42Q3V096 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ankrd42Q3V096 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ankrd42Q3V096 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ankrd42Q3V096 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ankrd42Q3V096 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ankrd42Q3V096 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ankrd42Q3V096 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ankrd42Q3V096 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ankrd42Q3V096 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ankrd42Q3V096 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ankrd42Q3V096 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ankrd42Q3V096 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ankrd42Q3V096 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ankrd42Q3V096 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ankrd42Q3V096 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ankrd42Q3V096 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ankrd42Q3V096 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ankrd42Q3V096 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ankrd42Q3V096 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ankrd42Q3V096 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ankrd42Q3V096 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ankrd42Q3V096 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ankrd42Q3V096 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ankrd42Q3V096 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ankrd42Q3V096 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ankrd42Q3V096 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ankrd42Q3V096 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ankrd42Q3V096 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ankrd42Q3V096 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ankrd42Q3V096 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ankrd42Q3V096 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ankrd42Q3V096 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ankrd42Q3V096 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ankrd42Q3V096 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ankrd42Q3V096 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ankrd42Q3V096 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ankrd42Q3V096 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ankrd42Q3V096 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ankrd42Q3V096 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ankrd42Q3V096 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ankrd42Q3V096 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ankrd42Q3V096 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ankrd42Q3V096 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ankrd42Q3V096 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ankrd42Q3V096 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ankrd42Q3V096 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ankrd42Q3V096 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ankrd42Q3V096 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ankrd42Q3V096 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ankrd42Q3V096 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ankrd42Q3V096 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ankrd42Q3V096 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ankrd42Q3V096 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ankrd42Q3V096 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ankrd42Q3V096 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ankrd42Q3V096 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ankrd42Q3V096 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ankrd42Q3V096 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ankrd42Q3V096 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Ankrd42Q3V096 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ankrd42Q3V096 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ankrd42Q3V096 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ankrd42Q3V096 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ankrd42Q3V096 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ankrd42Q3V096 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ankrd42Q3V096 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ankrd42Q3V096 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ankrd42Q3V096 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ankrd42Q3V096 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ankrd42Q3V096 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ankrd42Q3V096 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ankrd42Q3V096 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ankrd42Q3V096 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ankrd42Q3V096 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ankrd42Q3V096 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ankrd42Q3V096 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ankrd42Q3V096 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ankrd42Q3V096 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ankrd42Q3V096 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ankrd42Q3V096 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ankrd42Q3V096 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ankrd42Q3V096 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ankrd42Q3V096 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ankrd42Q3V096 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ankrd42Q3V096 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ankrd42Q3V096 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ankrd42Q3V096 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ankrd42Q3V096 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ankrd42Q3V096 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ankrd42Q3V096 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ankrd42Q3V096 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ankrd42Q3V096 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ankrd42Q3V096 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ankrd42Q3V096 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ankrd42Q3V096 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ankrd42Q3V096 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ankrd42Q3V096 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ankrd42Q3V096 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ankrd42Q3V096 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ankrd42Q3V096 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms