Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZD7

Fam71f1, Protein FAM71F1, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam71f1Q3UZD7 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam71f1Q3UZD7 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam71f1Q3UZD7 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam71f1Q3UZD7 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam71f1Q3UZD7 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam71f1Q3UZD7 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam71f1Q3UZD7 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam71f1Q3UZD7 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam71f1Q3UZD7 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam71f1Q3UZD7 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam71f1Q3UZD7 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam71f1Q3UZD7 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam71f1Q3UZD7 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam71f1Q3UZD7 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam71f1Q3UZD7 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam71f1Q3UZD7 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam71f1Q3UZD7 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam71f1Q3UZD7 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam71f1Q3UZD7 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam71f1Q3UZD7 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam71f1Q3UZD7 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam71f1Q3UZD7 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam71f1Q3UZD7 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam71f1Q3UZD7 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam71f1Q3UZD7 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam71f1Q3UZD7 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam71f1Q3UZD7 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam71f1Q3UZD7 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam71f1Q3UZD7 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam71f1Q3UZD7 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam71f1Q3UZD7 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam71f1Q3UZD7 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam71f1Q3UZD7 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam71f1Q3UZD7 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam71f1Q3UZD7 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam71f1Q3UZD7 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam71f1Q3UZD7 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam71f1Q3UZD7 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam71f1Q3UZD7 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam71f1Q3UZD7 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam71f1Q3UZD7 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam71f1Q3UZD7 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam71f1Q3UZD7 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam71f1Q3UZD7 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam71f1Q3UZD7 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam71f1Q3UZD7 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam71f1Q3UZD7 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam71f1Q3UZD7 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam71f1Q3UZD7 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam71f1Q3UZD7 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam71f1Q3UZD7 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam71f1Q3UZD7 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam71f1Q3UZD7 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam71f1Q3UZD7 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fam71f1Q3UZD7 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Fam71f1Q3UZD7 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fam71f1Q3UZD7 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fam71f1Q3UZD7 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fam71f1Q3UZD7 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam71f1Q3UZD7 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam71f1Q3UZD7 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam71f1Q3UZD7 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam71f1Q3UZD7 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam71f1Q3UZD7 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam71f1Q3UZD7 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam71f1Q3UZD7 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam71f1Q3UZD7 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam71f1Q3UZD7 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam71f1Q3UZD7 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam71f1Q3UZD7 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam71f1Q3UZD7 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam71f1Q3UZD7 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam71f1Q3UZD7 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam71f1Q3UZD7 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam71f1Q3UZD7 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam71f1Q3UZD7 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam71f1Q3UZD7 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Fam71f1Q3UZD7 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam71f1Q3UZD7 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam71f1Q3UZD7 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam71f1Q3UZD7 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Fam71f1Q3UZD7 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Fam71f1Q3UZD7 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam71f1Q3UZD7 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam71f1Q3UZD7 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam71f1Q3UZD7 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam71f1Q3UZD7 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam71f1Q3UZD7 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam71f1Q3UZD7 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam71f1Q3UZD7 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam71f1Q3UZD7 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam71f1Q3UZD7 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam71f1Q3UZD7 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam71f1Q3UZD7 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam71f1Q3UZD7 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam71f1Q3UZD7 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam71f1Q3UZD7 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam71f1Q3UZD7 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam71f1Q3UZD7 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam71f1Q3UZD7 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms