Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW22

Defb48, Beta-defensin 42, mousemouse

Predictions only

Length 87 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defb48Q3UW22 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Defb48Q3UW22 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Defb48Q3UW22 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Defb48Q3UW22 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Defb48Q3UW22 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Defb48Q3UW22 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Defb48Q3UW22 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Defb48Q3UW22 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Defb48Q3UW22 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Defb48Q3UW22 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Defb48Q3UW22 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Defb48Q3UW22 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Defb48Q3UW22 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Defb48Q3UW22 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Defb48Q3UW22 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Defb48Q3UW22 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Defb48Q3UW22 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Defb48Q3UW22 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Defb48Q3UW22 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Defb48Q3UW22 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Defb48Q3UW22 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Defb48Q3UW22 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Defb48Q3UW22 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Defb48Q3UW22 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Defb48Q3UW22 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Defb48Q3UW22 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Defb48Q3UW22 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Defb48Q3UW22 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Defb48Q3UW22 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Defb48Q3UW22 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Defb48Q3UW22 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Defb48Q3UW22 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Defb48Q3UW22 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Defb48Q3UW22 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Defb48Q3UW22 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Defb48Q3UW22 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Defb48Q3UW22 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Defb48Q3UW22 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Defb48Q3UW22 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Defb48Q3UW22 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Defb48Q3UW22 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Defb48Q3UW22 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Defb48Q3UW22 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Defb48Q3UW22 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Defb48Q3UW22 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Defb48Q3UW22 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Defb48Q3UW22 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Defb48Q3UW22 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Defb48Q3UW22 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Defb48Q3UW22 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Defb48Q3UW22 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Defb48Q3UW22 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Defb48Q3UW22 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Defb48Q3UW22 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Defb48Q3UW22 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Defb48Q3UW22 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Defb48Q3UW22 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Defb48Q3UW22 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Defb48Q3UW22 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Defb48Q3UW22 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Defb48Q3UW22 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Defb48Q3UW22 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Defb48Q3UW22 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Defb48Q3UW22 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Defb48Q3UW22 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Defb48Q3UW22 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Defb48Q3UW22 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Defb48Q3UW22 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Defb48Q3UW22 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Defb48Q3UW22 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Defb48Q3UW22 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Defb48Q3UW22 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Defb48Q3UW22 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Defb48Q3UW22 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Defb48Q3UW22 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Defb48Q3UW22 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Defb48Q3UW22 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Defb48Q3UW22 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Defb48Q3UW22 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Defb48Q3UW22 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Defb48Q3UW22 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Defb48Q3UW22 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Defb48Q3UW22 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Defb48Q3UW22 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Defb48Q3UW22 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Defb48Q3UW22 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Defb48Q3UW22 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Defb48Q3UW22 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Defb48Q3UW22 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Defb48Q3UW22 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Defb48Q3UW22 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Defb48Q3UW22 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Defb48Q3UW22 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Defb48Q3UW22 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Defb48Q3UW22 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Defb48Q3UW22 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Defb48Q3UW22 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Defb48Q3UW22 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Defb48Q3UW22 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Defb48Q3UW22 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms