Protein–RNA interactions for Protein: Q3UUV5

Skap1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap1Q3UUV5 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Skap1Q3UUV5 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Skap1Q3UUV5 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Skap1Q3UUV5 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Skap1Q3UUV5 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Skap1Q3UUV5 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Skap1Q3UUV5 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Skap1Q3UUV5 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Skap1Q3UUV5 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Skap1Q3UUV5 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Skap1Q3UUV5 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Skap1Q3UUV5 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Skap1Q3UUV5 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Skap1Q3UUV5 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Skap1Q3UUV5 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Skap1Q3UUV5 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Skap1Q3UUV5 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Skap1Q3UUV5 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Skap1Q3UUV5 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Skap1Q3UUV5 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Skap1Q3UUV5 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Skap1Q3UUV5 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Skap1Q3UUV5 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Skap1Q3UUV5 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Skap1Q3UUV5 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Skap1Q3UUV5 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Skap1Q3UUV5 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Skap1Q3UUV5 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Skap1Q3UUV5 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Skap1Q3UUV5 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Skap1Q3UUV5 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Skap1Q3UUV5 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Skap1Q3UUV5 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Skap1Q3UUV5 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Skap1Q3UUV5 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Skap1Q3UUV5 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Skap1Q3UUV5 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Skap1Q3UUV5 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Skap1Q3UUV5 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Skap1Q3UUV5 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Skap1Q3UUV5 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Skap1Q3UUV5 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Skap1Q3UUV5 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Skap1Q3UUV5 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Skap1Q3UUV5 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Skap1Q3UUV5 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Skap1Q3UUV5 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Skap1Q3UUV5 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Skap1Q3UUV5 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Skap1Q3UUV5 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Skap1Q3UUV5 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Skap1Q3UUV5 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Skap1Q3UUV5 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Skap1Q3UUV5 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Skap1Q3UUV5 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Skap1Q3UUV5 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Skap1Q3UUV5 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Skap1Q3UUV5 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Skap1Q3UUV5 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Skap1Q3UUV5 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Skap1Q3UUV5 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Skap1Q3UUV5 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Skap1Q3UUV5 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Skap1Q3UUV5 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Skap1Q3UUV5 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Skap1Q3UUV5 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Skap1Q3UUV5 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Skap1Q3UUV5 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Skap1Q3UUV5 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Skap1Q3UUV5 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Skap1Q3UUV5 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Skap1Q3UUV5 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Skap1Q3UUV5 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Skap1Q3UUV5 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Skap1Q3UUV5 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Skap1Q3UUV5 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Skap1Q3UUV5 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Skap1Q3UUV5 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Skap1Q3UUV5 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Skap1Q3UUV5 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Skap1Q3UUV5 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Skap1Q3UUV5 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Skap1Q3UUV5 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Skap1Q3UUV5 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Skap1Q3UUV5 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Skap1Q3UUV5 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Skap1Q3UUV5 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Skap1Q3UUV5 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Skap1Q3UUV5 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Skap1Q3UUV5 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Skap1Q3UUV5 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Skap1Q3UUV5 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Skap1Q3UUV5 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Skap1Q3UUV5 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Skap1Q3UUV5 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Skap1Q3UUV5 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Skap1Q3UUV5 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Skap1Q3UUV5 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Skap1Q3UUV5 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Skap1Q3UUV5 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms