Protein–RNA interactions for Protein: Q3USZ8

Deleted in autism protein 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3USZ8 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q3USZ8 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q3USZ8 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q3USZ8 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q3USZ8 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q3USZ8 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q3USZ8 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q3USZ8 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q3USZ8 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q3USZ8 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q3USZ8 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q3USZ8 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q3USZ8 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q3USZ8 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q3USZ8 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q3USZ8 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q3USZ8 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q3USZ8 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q3USZ8 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q3USZ8 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q3USZ8 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q3USZ8 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q3USZ8 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q3USZ8 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q3USZ8 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Q3USZ8 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Q3USZ8 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Q3USZ8 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q3USZ8 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q3USZ8 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q3USZ8 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q3USZ8 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q3USZ8 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q3USZ8 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q3USZ8 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Q3USZ8 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Q3USZ8 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Q3USZ8 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Q3USZ8 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Q3USZ8 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Q3USZ8 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Q3USZ8 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Q3USZ8 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q3USZ8 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q3USZ8 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q3USZ8 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q3USZ8 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Q3USZ8 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q3USZ8 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q3USZ8 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q3USZ8 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Q3USZ8 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q3USZ8 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q3USZ8 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q3USZ8 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q3USZ8 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q3USZ8 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q3USZ8 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q3USZ8 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q3USZ8 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q3USZ8 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q3USZ8 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q3USZ8 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q3USZ8 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q3USZ8 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q3USZ8 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q3USZ8 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q3USZ8 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q3USZ8 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q3USZ8 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q3USZ8 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q3USZ8 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q3USZ8 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q3USZ8 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q3USZ8 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q3USZ8 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q3USZ8 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Q3USZ8 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q3USZ8 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Q3USZ8 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q3USZ8 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q3USZ8 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q3USZ8 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q3USZ8 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q3USZ8 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q3USZ8 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q3USZ8 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q3USZ8 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q3USZ8 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Q3USZ8 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q3USZ8 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q3USZ8 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q3USZ8 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q3USZ8 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q3USZ8 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q3USZ8 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q3USZ8 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q3USZ8 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q3USZ8 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q3USZ8 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms