Protein–RNA interactions for Protein: Q3USJ8

Fchsd2, F-BAR and double SH3 domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fchsd2Q3USJ8 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fchsd2Q3USJ8 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fchsd2Q3USJ8 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fchsd2Q3USJ8 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fchsd2Q3USJ8 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fchsd2Q3USJ8 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fchsd2Q3USJ8 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fchsd2Q3USJ8 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fchsd2Q3USJ8 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fchsd2Q3USJ8 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fchsd2Q3USJ8 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fchsd2Q3USJ8 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Fchsd2Q3USJ8 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fchsd2Q3USJ8 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Fchsd2Q3USJ8 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fchsd2Q3USJ8 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fchsd2Q3USJ8 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fchsd2Q3USJ8 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Fchsd2Q3USJ8 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fchsd2Q3USJ8 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fchsd2Q3USJ8 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fchsd2Q3USJ8 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fchsd2Q3USJ8 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fchsd2Q3USJ8 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fchsd2Q3USJ8 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fchsd2Q3USJ8 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Fchsd2Q3USJ8 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fchsd2Q3USJ8 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fchsd2Q3USJ8 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Fchsd2Q3USJ8 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fchsd2Q3USJ8 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fchsd2Q3USJ8 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fchsd2Q3USJ8 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Fchsd2Q3USJ8 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fchsd2Q3USJ8 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fchsd2Q3USJ8 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fchsd2Q3USJ8 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fchsd2Q3USJ8 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fchsd2Q3USJ8 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fchsd2Q3USJ8 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fchsd2Q3USJ8 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fchsd2Q3USJ8 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fchsd2Q3USJ8 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fchsd2Q3USJ8 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fchsd2Q3USJ8 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fchsd2Q3USJ8 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fchsd2Q3USJ8 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fchsd2Q3USJ8 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fchsd2Q3USJ8 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fchsd2Q3USJ8 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fchsd2Q3USJ8 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fchsd2Q3USJ8 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fchsd2Q3USJ8 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fchsd2Q3USJ8 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fchsd2Q3USJ8 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fchsd2Q3USJ8 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Fchsd2Q3USJ8 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fchsd2Q3USJ8 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fchsd2Q3USJ8 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fchsd2Q3USJ8 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fchsd2Q3USJ8 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fchsd2Q3USJ8 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fchsd2Q3USJ8 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fchsd2Q3USJ8 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fchsd2Q3USJ8 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fchsd2Q3USJ8 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Fchsd2Q3USJ8 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fchsd2Q3USJ8 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fchsd2Q3USJ8 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fchsd2Q3USJ8 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fchsd2Q3USJ8 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fchsd2Q3USJ8 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fchsd2Q3USJ8 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fchsd2Q3USJ8 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fchsd2Q3USJ8 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fchsd2Q3USJ8 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fchsd2Q3USJ8 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fchsd2Q3USJ8 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fchsd2Q3USJ8 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fchsd2Q3USJ8 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fchsd2Q3USJ8 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fchsd2Q3USJ8 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fchsd2Q3USJ8 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fchsd2Q3USJ8 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fchsd2Q3USJ8 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fchsd2Q3USJ8 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fchsd2Q3USJ8 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fchsd2Q3USJ8 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fchsd2Q3USJ8 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fchsd2Q3USJ8 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fchsd2Q3USJ8 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fchsd2Q3USJ8 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Fchsd2Q3USJ8 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Fchsd2Q3USJ8 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fchsd2Q3USJ8 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fchsd2Q3USJ8 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fchsd2Q3USJ8 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Fchsd2Q3USJ8 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Fchsd2Q3USJ8 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Fchsd2Q3USJ8 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms