Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem253Q3UNB8 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem253Q3UNB8 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem253Q3UNB8 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem253Q3UNB8 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem253Q3UNB8 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem253Q3UNB8 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem253Q3UNB8 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem253Q3UNB8 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem253Q3UNB8 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem253Q3UNB8 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem253Q3UNB8 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem253Q3UNB8 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem253Q3UNB8 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem253Q3UNB8 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem253Q3UNB8 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem253Q3UNB8 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem253Q3UNB8 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem253Q3UNB8 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem253Q3UNB8 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem253Q3UNB8 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem253Q3UNB8 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem253Q3UNB8 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Tmem253Q3UNB8 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem253Q3UNB8 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem253Q3UNB8 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem253Q3UNB8 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem253Q3UNB8 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem253Q3UNB8 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem253Q3UNB8 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem253Q3UNB8 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem253Q3UNB8 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem253Q3UNB8 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem253Q3UNB8 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem253Q3UNB8 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem253Q3UNB8 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem253Q3UNB8 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem253Q3UNB8 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem253Q3UNB8 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem253Q3UNB8 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem253Q3UNB8 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem253Q3UNB8 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem253Q3UNB8 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem253Q3UNB8 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem253Q3UNB8 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem253Q3UNB8 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem253Q3UNB8 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem253Q3UNB8 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem253Q3UNB8 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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Tmem253Q3UNB8 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem253Q3UNB8 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem253Q3UNB8 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem253Q3UNB8 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem253Q3UNB8 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem253Q3UNB8 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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Tmem253Q3UNB8 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem253Q3UNB8 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem253Q3UNB8 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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Tmem253Q3UNB8 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem253Q3UNB8 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Tmem253Q3UNB8 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Tmem253Q3UNB8 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Tmem253Q3UNB8 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
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Tmem253Q3UNB8 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem253Q3UNB8 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem253Q3UNB8 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem253Q3UNB8 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem253Q3UNB8 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem253Q3UNB8 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem253Q3UNB8 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem253Q3UNB8 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem253Q3UNB8 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem253Q3UNB8 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem253Q3UNB8 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem253Q3UNB8 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem253Q3UNB8 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem253Q3UNB8 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem253Q3UNB8 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem253Q3UNB8 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem253Q3UNB8 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem253Q3UNB8 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem253Q3UNB8 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem253Q3UNB8 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem253Q3UNB8 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem253Q3UNB8 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem253Q3UNB8 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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