Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULD5

Mccc2, Methylcrotonoyl-CoA carboxylase beta chain, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mccc2Q3ULD5 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mccc2Q3ULD5 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mccc2Q3ULD5 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mccc2Q3ULD5 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mccc2Q3ULD5 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mccc2Q3ULD5 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mccc2Q3ULD5 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mccc2Q3ULD5 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mccc2Q3ULD5 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Mccc2Q3ULD5 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Mccc2Q3ULD5 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mccc2Q3ULD5 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mccc2Q3ULD5 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mccc2Q3ULD5 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mccc2Q3ULD5 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mccc2Q3ULD5 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mccc2Q3ULD5 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mccc2Q3ULD5 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mccc2Q3ULD5 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mccc2Q3ULD5 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mccc2Q3ULD5 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Mccc2Q3ULD5 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mccc2Q3ULD5 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mccc2Q3ULD5 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mccc2Q3ULD5 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mccc2Q3ULD5 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Mccc2Q3ULD5 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mccc2Q3ULD5 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mccc2Q3ULD5 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mccc2Q3ULD5 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mccc2Q3ULD5 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mccc2Q3ULD5 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mccc2Q3ULD5 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mccc2Q3ULD5 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mccc2Q3ULD5 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mccc2Q3ULD5 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mccc2Q3ULD5 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mccc2Q3ULD5 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mccc2Q3ULD5 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Mccc2Q3ULD5 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mccc2Q3ULD5 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mccc2Q3ULD5 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Mccc2Q3ULD5 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mccc2Q3ULD5 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mccc2Q3ULD5 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Mccc2Q3ULD5 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mccc2Q3ULD5 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mccc2Q3ULD5 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mccc2Q3ULD5 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mccc2Q3ULD5 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mccc2Q3ULD5 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mccc2Q3ULD5 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mccc2Q3ULD5 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mccc2Q3ULD5 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mccc2Q3ULD5 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mccc2Q3ULD5 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mccc2Q3ULD5 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mccc2Q3ULD5 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mccc2Q3ULD5 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mccc2Q3ULD5 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mccc2Q3ULD5 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mccc2Q3ULD5 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mccc2Q3ULD5 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mccc2Q3ULD5 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mccc2Q3ULD5 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mccc2Q3ULD5 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mccc2Q3ULD5 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mccc2Q3ULD5 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mccc2Q3ULD5 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mccc2Q3ULD5 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mccc2Q3ULD5 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Mccc2Q3ULD5 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mccc2Q3ULD5 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mccc2Q3ULD5 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mccc2Q3ULD5 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mccc2Q3ULD5 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mccc2Q3ULD5 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mccc2Q3ULD5 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Mccc2Q3ULD5 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mccc2Q3ULD5 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mccc2Q3ULD5 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mccc2Q3ULD5 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mccc2Q3ULD5 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mccc2Q3ULD5 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mccc2Q3ULD5 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mccc2Q3ULD5 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mccc2Q3ULD5 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mccc2Q3ULD5 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mccc2Q3ULD5 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mccc2Q3ULD5 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mccc2Q3ULD5 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mccc2Q3ULD5 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mccc2Q3ULD5 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mccc2Q3ULD5 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mccc2Q3ULD5 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mccc2Q3ULD5 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mccc2Q3ULD5 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mccc2Q3ULD5 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mccc2Q3ULD5 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mccc2Q3ULD5 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms