Protein–RNA interactions for Protein: Q3UKU4

Fam83f, Protein FAM83F, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam83fQ3UKU4 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fam83fQ3UKU4 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fam83fQ3UKU4 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fam83fQ3UKU4 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fam83fQ3UKU4 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Fam83fQ3UKU4 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Fam83fQ3UKU4 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Fam83fQ3UKU4 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fam83fQ3UKU4 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fam83fQ3UKU4 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fam83fQ3UKU4 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fam83fQ3UKU4 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam83fQ3UKU4 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam83fQ3UKU4 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam83fQ3UKU4 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam83fQ3UKU4 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam83fQ3UKU4 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam83fQ3UKU4 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam83fQ3UKU4 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam83fQ3UKU4 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam83fQ3UKU4 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam83fQ3UKU4 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam83fQ3UKU4 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam83fQ3UKU4 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam83fQ3UKU4 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam83fQ3UKU4 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam83fQ3UKU4 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam83fQ3UKU4 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam83fQ3UKU4 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam83fQ3UKU4 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam83fQ3UKU4 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam83fQ3UKU4 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam83fQ3UKU4 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam83fQ3UKU4 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam83fQ3UKU4 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam83fQ3UKU4 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam83fQ3UKU4 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam83fQ3UKU4 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam83fQ3UKU4 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam83fQ3UKU4 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam83fQ3UKU4 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam83fQ3UKU4 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam83fQ3UKU4 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam83fQ3UKU4 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam83fQ3UKU4 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam83fQ3UKU4 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam83fQ3UKU4 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam83fQ3UKU4 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam83fQ3UKU4 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam83fQ3UKU4 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam83fQ3UKU4 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam83fQ3UKU4 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam83fQ3UKU4 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam83fQ3UKU4 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam83fQ3UKU4 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam83fQ3UKU4 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam83fQ3UKU4 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam83fQ3UKU4 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam83fQ3UKU4 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam83fQ3UKU4 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam83fQ3UKU4 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam83fQ3UKU4 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam83fQ3UKU4 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam83fQ3UKU4 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam83fQ3UKU4 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam83fQ3UKU4 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam83fQ3UKU4 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam83fQ3UKU4 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam83fQ3UKU4 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam83fQ3UKU4 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam83fQ3UKU4 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam83fQ3UKU4 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam83fQ3UKU4 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam83fQ3UKU4 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fam83fQ3UKU4 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fam83fQ3UKU4 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fam83fQ3UKU4 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fam83fQ3UKU4 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fam83fQ3UKU4 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fam83fQ3UKU4 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Fam83fQ3UKU4 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Fam83fQ3UKU4 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fam83fQ3UKU4 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Fam83fQ3UKU4 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fam83fQ3UKU4 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Fam83fQ3UKU4 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fam83fQ3UKU4 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Fam83fQ3UKU4 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Fam83fQ3UKU4 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam83fQ3UKU4 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam83fQ3UKU4 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam83fQ3UKU4 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam83fQ3UKU4 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam83fQ3UKU4 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam83fQ3UKU4 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam83fQ3UKU4 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam83fQ3UKU4 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam83fQ3UKU4 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam83fQ3UKU4 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam83fQ3UKU4 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms