Protein–RNA interactions for Protein: Q3UK78

Pcgf5, Polycomb group RING finger protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcgf5Q3UK78 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pcgf5Q3UK78 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pcgf5Q3UK78 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pcgf5Q3UK78 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pcgf5Q3UK78 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pcgf5Q3UK78 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pcgf5Q3UK78 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pcgf5Q3UK78 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pcgf5Q3UK78 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pcgf5Q3UK78 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pcgf5Q3UK78 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pcgf5Q3UK78 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pcgf5Q3UK78 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Pcgf5Q3UK78 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pcgf5Q3UK78 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pcgf5Q3UK78 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pcgf5Q3UK78 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pcgf5Q3UK78 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pcgf5Q3UK78 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pcgf5Q3UK78 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pcgf5Q3UK78 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pcgf5Q3UK78 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pcgf5Q3UK78 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pcgf5Q3UK78 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pcgf5Q3UK78 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pcgf5Q3UK78 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pcgf5Q3UK78 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Pcgf5Q3UK78 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Pcgf5Q3UK78 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pcgf5Q3UK78 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pcgf5Q3UK78 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Pcgf5Q3UK78 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pcgf5Q3UK78 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pcgf5Q3UK78 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pcgf5Q3UK78 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pcgf5Q3UK78 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pcgf5Q3UK78 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pcgf5Q3UK78 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pcgf5Q3UK78 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pcgf5Q3UK78 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pcgf5Q3UK78 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pcgf5Q3UK78 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pcgf5Q3UK78 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pcgf5Q3UK78 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pcgf5Q3UK78 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pcgf5Q3UK78 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pcgf5Q3UK78 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pcgf5Q3UK78 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Pcgf5Q3UK78 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pcgf5Q3UK78 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pcgf5Q3UK78 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pcgf5Q3UK78 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pcgf5Q3UK78 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pcgf5Q3UK78 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pcgf5Q3UK78 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pcgf5Q3UK78 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pcgf5Q3UK78 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pcgf5Q3UK78 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pcgf5Q3UK78 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pcgf5Q3UK78 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pcgf5Q3UK78 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Pcgf5Q3UK78 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pcgf5Q3UK78 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pcgf5Q3UK78 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Pcgf5Q3UK78 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pcgf5Q3UK78 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pcgf5Q3UK78 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pcgf5Q3UK78 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pcgf5Q3UK78 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pcgf5Q3UK78 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pcgf5Q3UK78 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Pcgf5Q3UK78 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Pcgf5Q3UK78 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pcgf5Q3UK78 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pcgf5Q3UK78 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pcgf5Q3UK78 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pcgf5Q3UK78 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pcgf5Q3UK78 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pcgf5Q3UK78 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pcgf5Q3UK78 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pcgf5Q3UK78 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Pcgf5Q3UK78 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pcgf5Q3UK78 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pcgf5Q3UK78 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pcgf5Q3UK78 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pcgf5Q3UK78 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pcgf5Q3UK78 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pcgf5Q3UK78 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pcgf5Q3UK78 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pcgf5Q3UK78 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pcgf5Q3UK78 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pcgf5Q3UK78 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pcgf5Q3UK78 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pcgf5Q3UK78 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pcgf5Q3UK78 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pcgf5Q3UK78 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pcgf5Q3UK78 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pcgf5Q3UK78 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pcgf5Q3UK78 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pcgf5Q3UK78 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms