Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHH1

Zswim8, Zinc finger SWIM domain-containing protein 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zswim8Q3UHH1 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zswim8Q3UHH1 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zswim8Q3UHH1 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zswim8Q3UHH1 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zswim8Q3UHH1 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zswim8Q3UHH1 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zswim8Q3UHH1 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zswim8Q3UHH1 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Zswim8Q3UHH1 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zswim8Q3UHH1 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zswim8Q3UHH1 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zswim8Q3UHH1 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Zswim8Q3UHH1 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Zswim8Q3UHH1 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zswim8Q3UHH1 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zswim8Q3UHH1 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zswim8Q3UHH1 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zswim8Q3UHH1 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zswim8Q3UHH1 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zswim8Q3UHH1 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zswim8Q3UHH1 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zswim8Q3UHH1 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zswim8Q3UHH1 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zswim8Q3UHH1 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zswim8Q3UHH1 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zswim8Q3UHH1 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zswim8Q3UHH1 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zswim8Q3UHH1 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zswim8Q3UHH1 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zswim8Q3UHH1 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zswim8Q3UHH1 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zswim8Q3UHH1 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zswim8Q3UHH1 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zswim8Q3UHH1 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zswim8Q3UHH1 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zswim8Q3UHH1 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Zswim8Q3UHH1 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zswim8Q3UHH1 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zswim8Q3UHH1 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zswim8Q3UHH1 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zswim8Q3UHH1 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zswim8Q3UHH1 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zswim8Q3UHH1 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zswim8Q3UHH1 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zswim8Q3UHH1 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zswim8Q3UHH1 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zswim8Q3UHH1 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zswim8Q3UHH1 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zswim8Q3UHH1 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zswim8Q3UHH1 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zswim8Q3UHH1 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zswim8Q3UHH1 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zswim8Q3UHH1 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zswim8Q3UHH1 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zswim8Q3UHH1 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zswim8Q3UHH1 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zswim8Q3UHH1 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Zswim8Q3UHH1 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Zswim8Q3UHH1 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zswim8Q3UHH1 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zswim8Q3UHH1 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zswim8Q3UHH1 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Zswim8Q3UHH1 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zswim8Q3UHH1 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zswim8Q3UHH1 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zswim8Q3UHH1 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zswim8Q3UHH1 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zswim8Q3UHH1 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Zswim8Q3UHH1 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Zswim8Q3UHH1 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zswim8Q3UHH1 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zswim8Q3UHH1 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zswim8Q3UHH1 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zswim8Q3UHH1 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zswim8Q3UHH1 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zswim8Q3UHH1 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zswim8Q3UHH1 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zswim8Q3UHH1 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Zswim8Q3UHH1 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Zswim8Q3UHH1 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Zswim8Q3UHH1 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Zswim8Q3UHH1 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zswim8Q3UHH1 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Zswim8Q3UHH1 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zswim8Q3UHH1 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zswim8Q3UHH1 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zswim8Q3UHH1 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zswim8Q3UHH1 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zswim8Q3UHH1 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zswim8Q3UHH1 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zswim8Q3UHH1 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zswim8Q3UHH1 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zswim8Q3UHH1 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Zswim8Q3UHH1 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Zswim8Q3UHH1 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zswim8Q3UHH1 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Zswim8Q3UHH1 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zswim8Q3UHH1 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zswim8Q3UHH1 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zswim8Q3UHH1 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms