Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHB8

Ccdc177, Coiled-coil domain-containing protein 177, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc177Q3UHB8 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc177Q3UHB8 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc177Q3UHB8 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc177Q3UHB8 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc177Q3UHB8 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc177Q3UHB8 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc177Q3UHB8 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc177Q3UHB8 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc177Q3UHB8 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc177Q3UHB8 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc177Q3UHB8 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc177Q3UHB8 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc177Q3UHB8 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc177Q3UHB8 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc177Q3UHB8 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc177Q3UHB8 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc177Q3UHB8 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc177Q3UHB8 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc177Q3UHB8 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc177Q3UHB8 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc177Q3UHB8 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc177Q3UHB8 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc177Q3UHB8 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc177Q3UHB8 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc177Q3UHB8 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc177Q3UHB8 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc177Q3UHB8 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc177Q3UHB8 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc177Q3UHB8 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc177Q3UHB8 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc177Q3UHB8 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc177Q3UHB8 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc177Q3UHB8 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc177Q3UHB8 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc177Q3UHB8 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc177Q3UHB8 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc177Q3UHB8 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc177Q3UHB8 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc177Q3UHB8 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc177Q3UHB8 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc177Q3UHB8 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc177Q3UHB8 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc177Q3UHB8 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc177Q3UHB8 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc177Q3UHB8 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc177Q3UHB8 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc177Q3UHB8 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc177Q3UHB8 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc177Q3UHB8 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc177Q3UHB8 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc177Q3UHB8 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc177Q3UHB8 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc177Q3UHB8 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc177Q3UHB8 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc177Q3UHB8 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc177Q3UHB8 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc177Q3UHB8 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc177Q3UHB8 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc177Q3UHB8 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc177Q3UHB8 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc177Q3UHB8 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc177Q3UHB8 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc177Q3UHB8 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc177Q3UHB8 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc177Q3UHB8 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc177Q3UHB8 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc177Q3UHB8 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc177Q3UHB8 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc177Q3UHB8 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc177Q3UHB8 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc177Q3UHB8 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc177Q3UHB8 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc177Q3UHB8 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc177Q3UHB8 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc177Q3UHB8 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc177Q3UHB8 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc177Q3UHB8 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc177Q3UHB8 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc177Q3UHB8 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc177Q3UHB8 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc177Q3UHB8 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc177Q3UHB8 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc177Q3UHB8 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc177Q3UHB8 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc177Q3UHB8 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc177Q3UHB8 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc177Q3UHB8 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc177Q3UHB8 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc177Q3UHB8 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc177Q3UHB8 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc177Q3UHB8 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc177Q3UHB8 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc177Q3UHB8 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc177Q3UHB8 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc177Q3UHB8 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc177Q3UHB8 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc177Q3UHB8 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc177Q3UHB8 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc177Q3UHB8 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc177Q3UHB8 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms