Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trafd1Q3UDK1 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trafd1Q3UDK1 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trafd1Q3UDK1 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trafd1Q3UDK1 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trafd1Q3UDK1 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trafd1Q3UDK1 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trafd1Q3UDK1 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trafd1Q3UDK1 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trafd1Q3UDK1 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trafd1Q3UDK1 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trafd1Q3UDK1 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trafd1Q3UDK1 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trafd1Q3UDK1 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trafd1Q3UDK1 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Trafd1Q3UDK1 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trafd1Q3UDK1 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trafd1Q3UDK1 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trafd1Q3UDK1 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trafd1Q3UDK1 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trafd1Q3UDK1 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trafd1Q3UDK1 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Trafd1Q3UDK1 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trafd1Q3UDK1 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trafd1Q3UDK1 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trafd1Q3UDK1 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trafd1Q3UDK1 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Trafd1Q3UDK1 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trafd1Q3UDK1 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trafd1Q3UDK1 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trafd1Q3UDK1 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trafd1Q3UDK1 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trafd1Q3UDK1 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trafd1Q3UDK1 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trafd1Q3UDK1 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trafd1Q3UDK1 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trafd1Q3UDK1 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trafd1Q3UDK1 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trafd1Q3UDK1 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trafd1Q3UDK1 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trafd1Q3UDK1 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trafd1Q3UDK1 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trafd1Q3UDK1 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trafd1Q3UDK1 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trafd1Q3UDK1 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trafd1Q3UDK1 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trafd1Q3UDK1 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trafd1Q3UDK1 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trafd1Q3UDK1 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trafd1Q3UDK1 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trafd1Q3UDK1 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trafd1Q3UDK1 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Trafd1Q3UDK1 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trafd1Q3UDK1 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trafd1Q3UDK1 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trafd1Q3UDK1 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trafd1Q3UDK1 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trafd1Q3UDK1 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trafd1Q3UDK1 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trafd1Q3UDK1 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trafd1Q3UDK1 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trafd1Q3UDK1 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trafd1Q3UDK1 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Trafd1Q3UDK1 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Trafd1Q3UDK1 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trafd1Q3UDK1 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trafd1Q3UDK1 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trafd1Q3UDK1 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trafd1Q3UDK1 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trafd1Q3UDK1 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trafd1Q3UDK1 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trafd1Q3UDK1 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trafd1Q3UDK1 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trafd1Q3UDK1 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Trafd1Q3UDK1 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trafd1Q3UDK1 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trafd1Q3UDK1 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Trafd1Q3UDK1 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Trafd1Q3UDK1 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trafd1Q3UDK1 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trafd1Q3UDK1 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trafd1Q3UDK1 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trafd1Q3UDK1 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trafd1Q3UDK1 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trafd1Q3UDK1 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trafd1Q3UDK1 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trafd1Q3UDK1 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trafd1Q3UDK1 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trafd1Q3UDK1 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trafd1Q3UDK1 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trafd1Q3UDK1 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trafd1Q3UDK1 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trafd1Q3UDK1 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trafd1Q3UDK1 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trafd1Q3UDK1 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trafd1Q3UDK1 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trafd1Q3UDK1 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trafd1Q3UDK1 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trafd1Q3UDK1 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trafd1Q3UDK1 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms