Protein–RNA interactions for Protein: Q3UA06

Trip13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip13Q3UA06 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trip13Q3UA06 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trip13Q3UA06 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trip13Q3UA06 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trip13Q3UA06 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trip13Q3UA06 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trip13Q3UA06 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trip13Q3UA06 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trip13Q3UA06 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trip13Q3UA06 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trip13Q3UA06 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trip13Q3UA06 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trip13Q3UA06 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trip13Q3UA06 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trip13Q3UA06 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trip13Q3UA06 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trip13Q3UA06 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trip13Q3UA06 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trip13Q3UA06 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trip13Q3UA06 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trip13Q3UA06 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trip13Q3UA06 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trip13Q3UA06 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trip13Q3UA06 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trip13Q3UA06 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trip13Q3UA06 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trip13Q3UA06 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trip13Q3UA06 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trip13Q3UA06 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trip13Q3UA06 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trip13Q3UA06 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trip13Q3UA06 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trip13Q3UA06 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trip13Q3UA06 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trip13Q3UA06 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Trip13Q3UA06 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trip13Q3UA06 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trip13Q3UA06 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trip13Q3UA06 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trip13Q3UA06 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trip13Q3UA06 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trip13Q3UA06 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trip13Q3UA06 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trip13Q3UA06 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trip13Q3UA06 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Trip13Q3UA06 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trip13Q3UA06 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trip13Q3UA06 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trip13Q3UA06 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trip13Q3UA06 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trip13Q3UA06 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trip13Q3UA06 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Trip13Q3UA06 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Trip13Q3UA06 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Trip13Q3UA06 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Trip13Q3UA06 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trip13Q3UA06 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trip13Q3UA06 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trip13Q3UA06 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trip13Q3UA06 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trip13Q3UA06 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trip13Q3UA06 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trip13Q3UA06 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trip13Q3UA06 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trip13Q3UA06 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trip13Q3UA06 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trip13Q3UA06 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trip13Q3UA06 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trip13Q3UA06 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trip13Q3UA06 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trip13Q3UA06 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trip13Q3UA06 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trip13Q3UA06 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trip13Q3UA06 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trip13Q3UA06 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trip13Q3UA06 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trip13Q3UA06 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trip13Q3UA06 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trip13Q3UA06 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trip13Q3UA06 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trip13Q3UA06 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trip13Q3UA06 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Trip13Q3UA06 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trip13Q3UA06 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trip13Q3UA06 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Trip13Q3UA06 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trip13Q3UA06 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trip13Q3UA06 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trip13Q3UA06 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trip13Q3UA06 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trip13Q3UA06 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trip13Q3UA06 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trip13Q3UA06 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trip13Q3UA06 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trip13Q3UA06 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trip13Q3UA06 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trip13Q3UA06 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trip13Q3UA06 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trip13Q3UA06 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trip13Q3UA06 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms