Protein–RNA interactions for Protein: Q3U595

UPF0545 protein C22orf39 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U595 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q3U595 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q3U595 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q3U595 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q3U595 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q3U595 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q3U595 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q3U595 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q3U595 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Q3U595 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q3U595 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Q3U595 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q3U595 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q3U595 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q3U595 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q3U595 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q3U595 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Q3U595 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Q3U595 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q3U595 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q3U595 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q3U595 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q3U595 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q3U595 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q3U595 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q3U595 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q3U595 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q3U595 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q3U595 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q3U595 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q3U595 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q3U595 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Q3U595 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q3U595 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q3U595 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q3U595 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q3U595 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q3U595 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q3U595 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q3U595 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q3U595 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q3U595 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Q3U595 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q3U595 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q3U595 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q3U595 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q3U595 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q3U595 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q3U595 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Q3U595 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q3U595 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Q3U595 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q3U595 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q3U595 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q3U595 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q3U595 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q3U595 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q3U595 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q3U595 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q3U595 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q3U595 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q3U595 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q3U595 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q3U595 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q3U595 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q3U595 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q3U595 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q3U595 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Q3U595 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q3U595 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q3U595 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Q3U595 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q3U595 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Q3U595 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Q3U595 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q3U595 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q3U595 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q3U595 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q3U595 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q3U595 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q3U595 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q3U595 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q3U595 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q3U595 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q3U595 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q3U595 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q3U595 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q3U595 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q3U595 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q3U595 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q3U595 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Q3U595 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q3U595 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q3U595 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q3U595 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3U595 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3U595 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3U595 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3U595 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3U595 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms