Protein–RNA interactions for Protein: Q3U410

Klhl21, Kelch-like protein 21, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl21Q3U410 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Klhl21Q3U410 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Klhl21Q3U410 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Klhl21Q3U410 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Klhl21Q3U410 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klhl21Q3U410 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klhl21Q3U410 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klhl21Q3U410 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klhl21Q3U410 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klhl21Q3U410 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klhl21Q3U410 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klhl21Q3U410 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klhl21Q3U410 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klhl21Q3U410 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klhl21Q3U410 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klhl21Q3U410 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klhl21Q3U410 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klhl21Q3U410 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Klhl21Q3U410 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Klhl21Q3U410 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Klhl21Q3U410 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Klhl21Q3U410 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Klhl21Q3U410 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Klhl21Q3U410 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Klhl21Q3U410 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Klhl21Q3U410 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Klhl21Q3U410 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Klhl21Q3U410 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Klhl21Q3U410 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Klhl21Q3U410 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Klhl21Q3U410 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Klhl21Q3U410 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klhl21Q3U410 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klhl21Q3U410 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klhl21Q3U410 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klhl21Q3U410 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klhl21Q3U410 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Klhl21Q3U410 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klhl21Q3U410 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klhl21Q3U410 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klhl21Q3U410 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klhl21Q3U410 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klhl21Q3U410 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klhl21Q3U410 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klhl21Q3U410 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klhl21Q3U410 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klhl21Q3U410 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klhl21Q3U410 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klhl21Q3U410 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Klhl21Q3U410 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klhl21Q3U410 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Klhl21Q3U410 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klhl21Q3U410 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klhl21Q3U410 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klhl21Q3U410 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klhl21Q3U410 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klhl21Q3U410 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klhl21Q3U410 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klhl21Q3U410 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klhl21Q3U410 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klhl21Q3U410 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klhl21Q3U410 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Klhl21Q3U410 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Klhl21Q3U410 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Klhl21Q3U410 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Klhl21Q3U410 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Klhl21Q3U410 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Klhl21Q3U410 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Klhl21Q3U410 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Klhl21Q3U410 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Klhl21Q3U410 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Klhl21Q3U410 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Klhl21Q3U410 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Klhl21Q3U410 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Klhl21Q3U410 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Klhl21Q3U410 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Klhl21Q3U410 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Klhl21Q3U410 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Klhl21Q3U410 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Klhl21Q3U410 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Klhl21Q3U410 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Klhl21Q3U410 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Klhl21Q3U410 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Klhl21Q3U410 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Klhl21Q3U410 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Klhl21Q3U410 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Klhl21Q3U410 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Klhl21Q3U410 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Klhl21Q3U410 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Klhl21Q3U410 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Klhl21Q3U410 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Klhl21Q3U410 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Klhl21Q3U410 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Klhl21Q3U410 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Klhl21Q3U410 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Klhl21Q3U410 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Klhl21Q3U410 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Klhl21Q3U410 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Klhl21Q3U410 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Klhl21Q3U410 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms