Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K5

Kdm4d, Lysine-specific demethylase 4D, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4dQ3U2K5 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Kdm4dQ3U2K5 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Kdm4dQ3U2K5 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Kdm4dQ3U2K5 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Kdm4dQ3U2K5 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Kdm4dQ3U2K5 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Kdm4dQ3U2K5 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Kdm4dQ3U2K5 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Kdm4dQ3U2K5 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Kdm4dQ3U2K5 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Kdm4dQ3U2K5 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Kdm4dQ3U2K5 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Kdm4dQ3U2K5 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Kdm4dQ3U2K5 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Kdm4dQ3U2K5 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Kdm4dQ3U2K5 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Kdm4dQ3U2K5 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Kdm4dQ3U2K5 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Kdm4dQ3U2K5 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Kdm4dQ3U2K5 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Kdm4dQ3U2K5 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Kdm4dQ3U2K5 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Kdm4dQ3U2K5 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kdm4dQ3U2K5 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kdm4dQ3U2K5 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kdm4dQ3U2K5 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kdm4dQ3U2K5 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kdm4dQ3U2K5 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kdm4dQ3U2K5 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kdm4dQ3U2K5 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Kdm4dQ3U2K5 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kdm4dQ3U2K5 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kdm4dQ3U2K5 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kdm4dQ3U2K5 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kdm4dQ3U2K5 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kdm4dQ3U2K5 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kdm4dQ3U2K5 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kdm4dQ3U2K5 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kdm4dQ3U2K5 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kdm4dQ3U2K5 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kdm4dQ3U2K5 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kdm4dQ3U2K5 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kdm4dQ3U2K5 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kdm4dQ3U2K5 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kdm4dQ3U2K5 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kdm4dQ3U2K5 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kdm4dQ3U2K5 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Kdm4dQ3U2K5 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Kdm4dQ3U2K5 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Kdm4dQ3U2K5 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Kdm4dQ3U2K5 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Kdm4dQ3U2K5 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Kdm4dQ3U2K5 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Kdm4dQ3U2K5 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Kdm4dQ3U2K5 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Kdm4dQ3U2K5 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Kdm4dQ3U2K5 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Kdm4dQ3U2K5 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kdm4dQ3U2K5 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kdm4dQ3U2K5 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kdm4dQ3U2K5 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kdm4dQ3U2K5 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Kdm4dQ3U2K5 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kdm4dQ3U2K5 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kdm4dQ3U2K5 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kdm4dQ3U2K5 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Kdm4dQ3U2K5 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kdm4dQ3U2K5 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kdm4dQ3U2K5 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kdm4dQ3U2K5 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kdm4dQ3U2K5 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Kdm4dQ3U2K5 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Kdm4dQ3U2K5 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Kdm4dQ3U2K5 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Kdm4dQ3U2K5 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Kdm4dQ3U2K5 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Kdm4dQ3U2K5 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Kdm4dQ3U2K5 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Kdm4dQ3U2K5 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Kdm4dQ3U2K5 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Kdm4dQ3U2K5 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Kdm4dQ3U2K5 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Kdm4dQ3U2K5 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Kdm4dQ3U2K5 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Kdm4dQ3U2K5 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Kdm4dQ3U2K5 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Kdm4dQ3U2K5 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Kdm4dQ3U2K5 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Kdm4dQ3U2K5 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Kdm4dQ3U2K5 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Kdm4dQ3U2K5 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Kdm4dQ3U2K5 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Kdm4dQ3U2K5 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Kdm4dQ3U2K5 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Kdm4dQ3U2K5 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Kdm4dQ3U2K5 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Kdm4dQ3U2K5 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Kdm4dQ3U2K5 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Kdm4dQ3U2K5 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Kdm4dQ3U2K5 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms