Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K0

Fam193b, Protein FAM193B, mousemouse

Predictions only

Length 892 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam193bQ3U2K0 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Fam193bQ3U2K0 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Fam193bQ3U2K0 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Fam193bQ3U2K0 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Fam193bQ3U2K0 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Fam193bQ3U2K0 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Fam193bQ3U2K0 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Fam193bQ3U2K0 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Fam193bQ3U2K0 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Fam193bQ3U2K0 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Fam193bQ3U2K0 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Fam193bQ3U2K0 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Fam193bQ3U2K0 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Fam193bQ3U2K0 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Fam193bQ3U2K0 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Fam193bQ3U2K0 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Fam193bQ3U2K0 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Fam193bQ3U2K0 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Fam193bQ3U2K0 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Fam193bQ3U2K0 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Fam193bQ3U2K0 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Fam193bQ3U2K0 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Fam193bQ3U2K0 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Fam193bQ3U2K0 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Fam193bQ3U2K0 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Fam193bQ3U2K0 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Fam193bQ3U2K0 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Fam193bQ3U2K0 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Fam193bQ3U2K0 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Fam193bQ3U2K0 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Fam193bQ3U2K0 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Fam193bQ3U2K0 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Fam193bQ3U2K0 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Fam193bQ3U2K0 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Fam193bQ3U2K0 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Fam193bQ3U2K0 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Fam193bQ3U2K0 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Fam193bQ3U2K0 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Fam193bQ3U2K0 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Fam193bQ3U2K0 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Fam193bQ3U2K0 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Fam193bQ3U2K0 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Fam193bQ3U2K0 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Fam193bQ3U2K0 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Fam193bQ3U2K0 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Fam193bQ3U2K0 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Fam193bQ3U2K0 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Fam193bQ3U2K0 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Fam193bQ3U2K0 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Fam193bQ3U2K0 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Fam193bQ3U2K0 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Fam193bQ3U2K0 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Fam193bQ3U2K0 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Fam193bQ3U2K0 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Fam193bQ3U2K0 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Fam193bQ3U2K0 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Fam193bQ3U2K0 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Fam193bQ3U2K0 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
Fam193bQ3U2K0 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Fam193bQ3U2K0 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Fam193bQ3U2K0 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Fam193bQ3U2K0 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Fam193bQ3U2K0 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Fam193bQ3U2K0 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Fam193bQ3U2K0 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Fam193bQ3U2K0 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Fam193bQ3U2K0 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Fam193bQ3U2K0 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Fam193bQ3U2K0 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Fam193bQ3U2K0 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Fam193bQ3U2K0 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Fam193bQ3U2K0 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Fam193bQ3U2K0 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Fam193bQ3U2K0 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Fam193bQ3U2K0 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Fam193bQ3U2K0 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Fam193bQ3U2K0 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Fam193bQ3U2K0 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Fam193bQ3U2K0 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Fam193bQ3U2K0 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Fam193bQ3U2K0 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Fam193bQ3U2K0 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Fam193bQ3U2K0 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Fam193bQ3U2K0 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Fam193bQ3U2K0 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Fam193bQ3U2K0 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Fam193bQ3U2K0 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Fam193bQ3U2K0 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Fam193bQ3U2K0 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Fam193bQ3U2K0 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Fam193bQ3U2K0 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Fam193bQ3U2K0 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Fam193bQ3U2K0 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Fam193bQ3U2K0 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Fam193bQ3U2K0 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Fam193bQ3U2K0 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Fam193bQ3U2K0 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Fam193bQ3U2K0 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Fam193bQ3U2K0 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Fam193bQ3U2K0 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms