Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0P1

Palb2, Partner and localizer of BRCA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palb2Q3U0P1 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Palb2Q3U0P1 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Palb2Q3U0P1 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Palb2Q3U0P1 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Palb2Q3U0P1 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Palb2Q3U0P1 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Palb2Q3U0P1 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Palb2Q3U0P1 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Palb2Q3U0P1 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Palb2Q3U0P1 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Palb2Q3U0P1 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Palb2Q3U0P1 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Palb2Q3U0P1 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Palb2Q3U0P1 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Palb2Q3U0P1 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Palb2Q3U0P1 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Palb2Q3U0P1 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Palb2Q3U0P1 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Palb2Q3U0P1 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Palb2Q3U0P1 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Palb2Q3U0P1 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Palb2Q3U0P1 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Palb2Q3U0P1 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Palb2Q3U0P1 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Palb2Q3U0P1 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Palb2Q3U0P1 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Palb2Q3U0P1 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Palb2Q3U0P1 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Palb2Q3U0P1 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Palb2Q3U0P1 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Palb2Q3U0P1 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Palb2Q3U0P1 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Palb2Q3U0P1 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Palb2Q3U0P1 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Palb2Q3U0P1 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Palb2Q3U0P1 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Palb2Q3U0P1 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Palb2Q3U0P1 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Palb2Q3U0P1 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Palb2Q3U0P1 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Palb2Q3U0P1 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Palb2Q3U0P1 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Palb2Q3U0P1 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Palb2Q3U0P1 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Palb2Q3U0P1 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Palb2Q3U0P1 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Palb2Q3U0P1 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Palb2Q3U0P1 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Palb2Q3U0P1 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Palb2Q3U0P1 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Palb2Q3U0P1 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Palb2Q3U0P1 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Palb2Q3U0P1 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Palb2Q3U0P1 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Palb2Q3U0P1 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Palb2Q3U0P1 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Palb2Q3U0P1 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Palb2Q3U0P1 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Palb2Q3U0P1 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Palb2Q3U0P1 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Palb2Q3U0P1 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Palb2Q3U0P1 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Palb2Q3U0P1 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Palb2Q3U0P1 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Palb2Q3U0P1 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Palb2Q3U0P1 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Palb2Q3U0P1 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Palb2Q3U0P1 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Palb2Q3U0P1 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Palb2Q3U0P1 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Palb2Q3U0P1 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Palb2Q3U0P1 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Palb2Q3U0P1 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Palb2Q3U0P1 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Palb2Q3U0P1 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Palb2Q3U0P1 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Palb2Q3U0P1 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Palb2Q3U0P1 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Palb2Q3U0P1 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Palb2Q3U0P1 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Palb2Q3U0P1 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Palb2Q3U0P1 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Palb2Q3U0P1 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Palb2Q3U0P1 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Palb2Q3U0P1 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Palb2Q3U0P1 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Palb2Q3U0P1 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Palb2Q3U0P1 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Palb2Q3U0P1 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Palb2Q3U0P1 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Palb2Q3U0P1 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Palb2Q3U0P1 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Palb2Q3U0P1 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Palb2Q3U0P1 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Palb2Q3U0P1 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Palb2Q3U0P1 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Palb2Q3U0P1 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Palb2Q3U0P1 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Palb2Q3U0P1 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Palb2Q3U0P1 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms