Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0J8

Tbc1d2b, TBC1 domain family member 2B, mousemouse

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Length 965 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbc1d2bQ3U0J8 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tbc1d2bQ3U0J8 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tbc1d2bQ3U0J8 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tbc1d2bQ3U0J8 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tbc1d2bQ3U0J8 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tbc1d2bQ3U0J8 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tbc1d2bQ3U0J8 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tbc1d2bQ3U0J8 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tbc1d2bQ3U0J8 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tbc1d2bQ3U0J8 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tbc1d2bQ3U0J8 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tbc1d2bQ3U0J8 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tbc1d2bQ3U0J8 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tbc1d2bQ3U0J8 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tbc1d2bQ3U0J8 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tbc1d2bQ3U0J8 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tbc1d2bQ3U0J8 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Tbc1d2bQ3U0J8 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Tbc1d2bQ3U0J8 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tbc1d2bQ3U0J8 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tbc1d2bQ3U0J8 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tbc1d2bQ3U0J8 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tbc1d2bQ3U0J8 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tbc1d2bQ3U0J8 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tbc1d2bQ3U0J8 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tbc1d2bQ3U0J8 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tbc1d2bQ3U0J8 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tbc1d2bQ3U0J8 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tbc1d2bQ3U0J8 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tbc1d2bQ3U0J8 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Tbc1d2bQ3U0J8 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tbc1d2bQ3U0J8 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Tbc1d2bQ3U0J8 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tbc1d2bQ3U0J8 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tbc1d2bQ3U0J8 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tbc1d2bQ3U0J8 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tbc1d2bQ3U0J8 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tbc1d2bQ3U0J8 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tbc1d2bQ3U0J8 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tbc1d2bQ3U0J8 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tbc1d2bQ3U0J8 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tbc1d2bQ3U0J8 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tbc1d2bQ3U0J8 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tbc1d2bQ3U0J8 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tbc1d2bQ3U0J8 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tbc1d2bQ3U0J8 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tbc1d2bQ3U0J8 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Tbc1d2bQ3U0J8 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Tbc1d2bQ3U0J8 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tbc1d2bQ3U0J8 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tbc1d2bQ3U0J8 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tbc1d2bQ3U0J8 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tbc1d2bQ3U0J8 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tbc1d2bQ3U0J8 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tbc1d2bQ3U0J8 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tbc1d2bQ3U0J8 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tbc1d2bQ3U0J8 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Tbc1d2bQ3U0J8 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tbc1d2bQ3U0J8 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tbc1d2bQ3U0J8 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tbc1d2bQ3U0J8 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tbc1d2bQ3U0J8 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tbc1d2bQ3U0J8 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tbc1d2bQ3U0J8 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tbc1d2bQ3U0J8 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tbc1d2bQ3U0J8 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tbc1d2bQ3U0J8 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tbc1d2bQ3U0J8 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tbc1d2bQ3U0J8 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tbc1d2bQ3U0J8 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tbc1d2bQ3U0J8 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tbc1d2bQ3U0J8 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tbc1d2bQ3U0J8 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tbc1d2bQ3U0J8 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Tbc1d2bQ3U0J8 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tbc1d2bQ3U0J8 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Tbc1d2bQ3U0J8 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tbc1d2bQ3U0J8 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tbc1d2bQ3U0J8 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Tbc1d2bQ3U0J8 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tbc1d2bQ3U0J8 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tbc1d2bQ3U0J8 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tbc1d2bQ3U0J8 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tbc1d2bQ3U0J8 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Tbc1d2bQ3U0J8 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tbc1d2bQ3U0J8 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tbc1d2bQ3U0J8 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tbc1d2bQ3U0J8 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tbc1d2bQ3U0J8 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Tbc1d2bQ3U0J8 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms